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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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alexguo221

金虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质相互作用?

如果我只有两个蛋白质的氨基酸序列,我想知道这两个蛋白质是否可能有相互作用。可以有什么软件预测吗。谢谢
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世道再难,也要呼吸顺畅。
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


1949stone(金币+1): 鼓励 2011-11-11 09:54:40
可以预测一下是否有相关的蛋白结构域,实验上要用pull-down,Y2H,或是CO-IP来验证。
jiayoubashaonian
2楼2011-11-10 22:06:57
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alexguo221

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-11-10 22:06:57:
可以预测一下是否有相关的蛋白结构域,实验上要用pull-down,Y2H,或是CO-IP来验证。

主要是这样一个病毒上有十几个蛋白,我想知道那十几个蛋白是否与细胞内某个蛋白有相互作用。所以我想先找个东西预测下。全部克隆出来太费时间。
请教一下,如何预测蛋白质结构与,我对这方面完全不懂。什么样的结构域,有可能会有相互作用。

谢谢
世道再难,也要呼吸顺畅。
3楼2011-11-10 22:12:05
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by alexguo221 at 2011-11-10 22:12:05:
主要是这样一个病毒上有十几个蛋白,我想知道那十几个蛋白是否与细胞内某个蛋白有相互作用。所以我想先找个东西预测下。全部克隆出来太费时间。
请教一下,如何预测蛋白质结构与,我对这方面完全不懂。什么样的 ...

呵呵,预测蛋白结构的有好多软件,包括NCBI,或是SMART上的,楼主可以先找一下文章看看有没有做过的证明和你的蛋白有互作的,如果没有的话,可以到NCBI上大体看一下annotation,初步了解一下蛋白的可能功能,结合文献判断。
jiayoubashaonian
4楼2011-11-10 22:16:21
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进不出的再见

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

先到pdb上找找看有没有你要的蛋白的结构。
5楼2012-11-07 20:53:34
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