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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 蛋白质相互作用？
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alexguo221

金虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质相互作用？

如果我只有两个蛋白质的氨基酸序列，我想知道这两个蛋白质是否可能有相互作用。可以有什么软件预测吗。谢谢
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世道再难，也要呼吸顺畅。
1楼 2011-11-10 22:03:39
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
1949stone(金币+1): 鼓励 2011-11-11 09:54:40
可以预测一下是否有相关的蛋白结构域，实验上要用pull-down，Y2H，或是CO-IP来验证。
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jiayoubashaonian
2楼2011-11-10 22:06:57
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alexguo221

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-11-10 22:06:57:
可以预测一下是否有相关的蛋白结构域，实验上要用pull-down，Y2H，或是CO-IP来验证。

主要是这样一个病毒上有十几个蛋白，我想知道那十几个蛋白是否与细胞内某个蛋白有相互作用。所以我想先找个东西预测下。全部克隆出来太费时间。
请教一下，如何预测蛋白质结构与，我对这方面完全不懂。什么样的结构域，有可能会有相互作用。

谢谢
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世道再难，也要呼吸顺畅。
3楼2011-11-10 22:12:05
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by alexguo221 at 2011-11-10 22:12:05:
主要是这样一个病毒上有十几个蛋白，我想知道那十几个蛋白是否与细胞内某个蛋白有相互作用。所以我想先找个东西预测下。全部克隆出来太费时间。
请教一下，如何预测蛋白质结构与，我对这方面完全不懂。什么样的 ...

呵呵，预测蛋白结构的有好多软件，包括NCBI，或是SMART上的，楼主可以先找一下文章看看有没有做过的证明和你的蛋白有互作的，如果没有的话，可以到NCBI上大体看一下annotation，初步了解一下蛋白的可能功能，结合文献判断。
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jiayoubashaonian
4楼2011-11-10 22:16:21
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进不出的再见

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

先到pdb上找找看有没有你要的蛋白的结构。
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5楼2012-11-07 20:53:34
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