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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教各位大虾 DGGE电泳图哪个参数要改
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木子勇夏

新虫 (小有名气)

[求助] 请教各位大虾 DGGE电泳图哪个参数要改

新手上路，大家多多指教。

DGGE.jpg
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1楼 2013-01-05 16:50:34
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在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
20楼: Originally posted by 木子勇夏 at 2013-01-16 08:31:59
我想问下，这电压跟胶的浓度或者是片段大小之间有个什么样的关系啊，是不是片段大，用的电压就低些，或者是其他的呢？有没有一个规律之类的。新接触这领域，不太懂，请赐教。...

对于特定片段长度的，一般是有比较合适的电压和电泳时间的。大概有个范围。

对于细菌V3 338 518这样的200bp左右的，我们一般是70-80V，12h，或者120V，10h

真菌NS1和Fung扩增大概349bp，我们一般选择100V，12h，或者较高一点电压。不过最好不要太大。

细菌341F与907这种做起来，难度大，不过我们也做的很好，我们一般是140V，16-18h，效果很好。
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22楼2013-01-16 09:08:00
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木子勇夏

新虫 (小有名气)
条带大小业约为200bp，电压 160V 温度58   4.5h
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2楼2013-01-05 16:56:12
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elbo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的样品是什么？胶的梯度呢？跑的时间太短了，160V怎么也得7个小时吧，细菌的DGGE有人推荐1230V.h这个条件
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3楼2013-01-05 19:10:35
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木子勇夏

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by elbo at 2013-01-05 19:10:35
你的样品是什么？胶的梯度呢？跑的时间太短了，160V怎么也得7个小时吧，细菌的DGGE有人推荐1230V.h这个条件

谢谢您哦，细菌的我的这个条件跑得挺好的，这个是真菌的，参照别人的条件，跑出来的效果却是这样的，太不理想了。   胶梯度是10%~35%。
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4楼2013-01-06 08:34:58
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