[求助] 请教各位大虾 DGGE电泳图哪个参数要改

» 猜你喜欢

为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种? 已经有5人回复
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》已经有3人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有226人回复
求助食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社电子版已经有5人回复
胶体几丁质的结晶度？已经有0人回复
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士已经有2人回复
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线已经有5人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

求助各位师兄师姐们高手们，帮我看看DGGE图，效果不好，问题出在哪里？求助，谢谢已经有12人回复
Matlab 实现DGGE电泳图谱的泳道多样性指数，相似性指数，泳道聚类分析已经有26人回复
求助-TGGE和DGGE的电泳图谱已经有3人回复
DGGE电泳为什么要预热电泳缓冲液到60度？已经有4人回复
【求助/交流】关于DGGE电泳仪的改装已经有4人回复
【求助/交流】请教DGGE电泳图已经有7人回复
【求助】请教各位有谁做过pcr-SSCP，他和PCR-DGGE哪个用于确定优势菌更有效果？已经有3人回复

1楼2013-01-05 16:50:34

木子勇夏

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 625.8
散金: 15
帖子: 133
在线: 39.2小时
虫号: 888216
注册: 2009-10-30
专业: 环境微生物学

条带大小业约为200bp，电压 160V 温度58 4.5h

2楼2013-01-05 16:56:12

木子勇夏

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 625.8
散金: 15
帖子: 133
在线: 39.2小时
虫号: 888216
注册: 2009-10-30
专业: 环境微生物学

引用回帖:

3楼: Originally posted by elbo at 2013-01-05 19:10:35
你的样品是什么？胶的梯度呢？跑的时间太短了，160V怎么也得7个小时吧，细菌的DGGE有人推荐1230V.h这个条件

谢谢您哦，细菌的我的这个条件跑得挺好的，这个是真菌的，参照别人的条件，跑出来的效果却是这样的，太不理想了。胶梯度是10%~35%。

4楼2013-01-06 08:34:58

木子勇夏

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 625.8
散金: 15
帖子: 133
在线: 39.2小时
虫号: 888216
注册: 2009-10-30
专业: 环境微生物学

引用回帖:

5楼: Originally posted by elbo at 2013-01-06 12:35:29
我觉得你应该改胶的浓度

哦，谢谢。不知道浓度方面有什么建议呢？

6楼2013-01-07 10:32:08

木子勇夏

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 625.8
散金: 15
帖子: 133
在线: 39.2小时
虫号: 888216
注册: 2009-10-30
专业: 环境微生物学

送鲜花一朵

引用回帖:

7楼: Originally posted by elbo at 2013-01-07 13:02:33
我同学跑土壤真菌 30-50梯度，你看你DGGE图谱中带没跑开，很可能是胶浓度不对

哦，谢谢你的提示，我也要尝试一下，请问你同学的引物是NS1+GC-Fung吗？条带大小是不是300左右？
我之前跑真菌试过18%~38%，也差不多是这样的图。

8楼2013-01-08 11:01:18

木子勇夏

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 625.8
散金: 15
帖子: 133
在线: 39.2小时
虫号: 888216
注册: 2009-10-30
专业: 环境微生物学

引用回帖:

10楼: Originally posted by xiaowo1127 at 2013-01-10 15:47:43
楼主，你好，我想请教一下，你是做土壤微生物的吗？我是研究这方面的，但是做过很多次，PCR始终不成功，请问楼主能否把你的细菌PCR条件给我看一下呢~~~

细菌的比较容易，你看看这文献可能对你有帮助，我就这么参考的：Characterization of bacterial diversity in two aerated lagoons of a wastewater treatment plant using PCR–DGGE analysis
不过我不用EB染色，对人体伤害太大了。你可以找替代物。

11楼2013-01-11 08:46:02