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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 使用MS的Amorphous cell计算coal的密度时出现这样的提示
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孤独中生存

银虫 (正式写手)

[求助] 使用MS的Amorphous cell计算coal的密度时出现这样的提示

使用MS的Amorphous cell计算coal的密度时出现这样的提示：The structures in the arc file have not been refined.  Please use the Basic Refine protocol to refine these.

这个截图是在设定密度为0.8g/cc时出现的。

我把密度设定在0.6g/cc和0.61g/cc的时候也出现了同样的问题，希望哪位学长能够解答一下，感激不尽，谢谢

输出文件（out格式）最后几行
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LOVE MY LOVE
1楼 2013-01-05 08:39:40
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孤独中生存

银虫 (正式写手)
自己先顶下
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LOVE MY LOVE
2楼2013-01-05 08:40:10
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孤独中生存

银虫 (正式写手)
come on ，高手不在线么？很急呀
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LOVE MY LOVE
3楼2013-01-05 09:05:29
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
孤独中生存: 金币+1, ★有帮助 2013-01-11 15:42:16
你这个建模是因为分子都缠到一起了，在建模的时候，可以在盒子中加入200个CH4分子，然后建好盒子除去，这样分子就不会缠绕到一起了。
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
4楼2013-01-11 13:57:03
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