24小时热门版块排行榜    

查看: 1942  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

[求助] dump出文件显示问题

我的体系一个fcc排列的ar原子,用dump输出的lammpstrj格式的文件,是多帧的,而且ID是打乱的,求了cna,后面带着这个值,想在vmd里面显示出不同cna值得颜色,所有帧都显示,然后做成动画,不知道有什么合适的方法吗?

[ Last edited by zhang_jaj on 2012-12-17 at 20:25 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wangyujia at 2012-12-19 08:26:37
正如你所了解的,vmd要写脚本,很麻烦。我以前也用过vmd,后来放弃了。...

谢谢,我主要关注的是它能不能实现我用lammps输出文件里关于后面compute计算得到的值得显示;对于是否动画倒没那么一定需要,谢谢啦
9楼2012-12-19 15:03:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-18 15:43:22
可以在VMD里设置,如分子标识等。。 VMD可以完成你要的一切。。
2楼2012-12-18 08:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-18 08:57:04
可以在VMD里设置,如分子标识等。。 VMD可以完成你要的一切。。

顶楼上

搞MD,真应该好好学习一下VMD 的使用。
3楼2012-12-18 15:44:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-18 21:57:48
zhang_jaj: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 算然不是vmd,但是目的达到了,谢谢 2012-12-20 19:01:54
我建议你用Atomeye,牛人李巨写的,非常好用,可以做出非常漂亮的图,也可以做成动画。
4楼2012-12-18 16:49:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
信息提示
请填处理意见