24小时热门版块排行榜    

查看: 1821  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

[求助] dump出文件显示问题

我的体系一个fcc排列的ar原子,用dump输出的lammpstrj格式的文件,是多帧的,而且ID是打乱的,求了cna,后面带着这个值,想在vmd里面显示出不同cna值得颜色,所有帧都显示,然后做成动画,不知道有什么合适的方法吗?

[ Last edited by zhang_jaj on 2012-12-17 at 20:25 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-18 21:57:48
zhang_jaj: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 算然不是vmd,但是目的达到了,谢谢 2012-12-20 19:01:54
我建议你用Atomeye,牛人李巨写的,非常好用,可以做出非常漂亮的图,也可以做成动画。
4楼2012-12-18 16:49:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-12-18 21:05:08
非常感谢!不敢再搞太多软件了,精力有限啊。。。...

正如你所了解的,vmd要写脚本,很麻烦。我以前也用过vmd,后来放弃了。
8楼2012-12-19 08:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-12-19 15:03:39
谢谢,我主要关注的是它能不能实现我用lammps输出文件里关于后面compute计算得到的值得显示;对于是否动画倒没那么一定需要,谢谢啦...

atomeye正好是做图片功能强,做动画的话还比较麻烦,需要自己用其它的软件把N张图连起来。呵呵!
10楼2012-12-19 15:15:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-12-19 21:03:07
谢谢,我是想知道能不能把lammps里面用compute算的比如cna/atom不同的值以不同的颜色显示出来?...

可以。
12楼2012-12-20 08:28:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by yuanxm at 2012-12-20 08:44:06
如何根据不同的atom或atom不同的值以不同的颜色显示出来?还请大侠能详细点介绍,先谢谢了!...

这个还是自己去看说明书吧!
我可以告诉你看“Auxiliary Property Coloring”这一节。
14楼2012-12-20 15:17:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhang_jaj 的主题更新
信息提示
请填处理意见