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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 一段序列设计的同一个引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析结果不一样
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sherrysure

银虫 (小有名气)

[求助] 一段序列设计的同一个引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析结果不一样

为什么一段序列里设计的同一个引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析的结果不一样呢？
oligo里TM值63，到primer里分析TM分析是58，为什么呢？

求大侠指教~~
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1楼2012-12-16 14:44:36
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果是普通PCR，引物合成报告单上的Tm值减个2度一般都能跑出带
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我们的过去，成就了如今的我们，无需悔恨
3楼2012-12-16 21:51:36
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小小技术官

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
两个软件关于Tm值的运算方法有差异，oligo比较好一点
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生活是一面镜子，要笑着面对！
4楼2012-12-16 22:06:53
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tiansiqin

铜虫 (初入文坛)
两个软件的tm估算值方式不一样，各有其优缺点，一般我建议用primer 5 ，进行自动搜索功能，然后用oligo6 进行分析。oligo6 的tm只可信度好一些！有必要可以跑一个梯度！
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学会成长为自己的样子
5楼2013-01-07 09:50:29
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