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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps计算结果xyz文件中每个数字代表的字符长短。
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herarysara

木虫 (小有名气)

[求助] lammps计算结果xyz文件中每个数字代表的字符长短。

lammps计算结果xyz文件，想提出文件中的数据，用c++的文件指针，可是不知道每个数据的字符长短，应该怎么确定，求赐教！
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1楼 2012-12-04 19:55:57
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-04 22:12:40
1、lammps是开源软件，你为什么不去看看源程序呢？

2、你为什么不试试用lammps输出那么一小段xyz格式的结果，查看一下呢？

谢谢你的回复，其实我就是想知道他的输出文件每一行所占的字符数，单纯从文件上看到的字节数是不一样的。
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3楼2012-12-05 09:49:33
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herarysara

木虫 (小有名气)
既是从xyz文件中，用fgets命令取走每个坐标如fgets(str,20,from)中间的20指每个坐标的字符长度，我想知道的就是这个数字应该怎么确定。xyz文件每行对应多少个字符。
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4楼2012-12-05 11:47:01
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herarysara

木虫 (小有名气)
确实没咋看懂，我是用文件指针形式逐个读取xyz文件中的数据，因为涉及到轨迹文件几十万帧，感觉这样实现不了。不过还是非常感谢你的回复。
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6楼2012-12-06 17:07:34
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by jiangtao9571 at 2012-12-07 09:56:01
你看不出来我也是用文件指针形式逐个读取xyz文件中的数据吗？？？  涉及几十万帧  加一个循环即可：
如下：step = timestep/10000；
        step=0;
        while(step<20)
        {
        readdata();
        mol=atom_tol/ato ...

你上面的程序，是有指定选取80个字符吗？如果是，我就是想知道读取这个字符长度该怎样确定。
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8楼2012-12-07 16:54:34
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-08 10:25:32
不知道你的问题解决了没？
xyz文件内，主要就是存储的是原子的坐标信息吧？
如果把xyz轨迹文件导入到VMD，使用命令：
set sel
$sel get {x y z}
就可以读取出你所需要的原子的坐标了
如果只需x坐标，就写成  ...

谢谢你的回复，我不是要单纯得到某个原子的坐标数字，我是想以字符串的的形式读取。
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10楼2012-12-09 10:56:50
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