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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 微米和纳米 » 学术交流 » Lammps计算SiO2熔点，原子丢失错误
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MR_LeeDD

新虫 (初入文坛)

[交流] Lammps计算SiO2熔点，原子丢失错误

　　是用Materials Studio 6.0建模导出data文件然后读取，看到有人说是data文件的问题，换了好几个还是一样的结果，导师给我一个现成的data文件还是一样的错误，ERROR: Lost atoms: original 2663 current 2509 (../thermo.cpp:401)
我觉得是in文件出错，in文件编的很简单，各位大神看看需要怎么改？
units metal
boundary p p p
atom_style full
variable x equal 2.5
read_data   data.emd

timestep 0.01
thermo 1000
pair_style          tersoff
pair_coeff           * * SiO.tersoff Si O

neighbor 0.5 bin
neigh_modify every 5 delay 0 check yes

#velocity all create $x 825577 dist gaussian
fix 1 all nvt temp $x 2000 1.0
dump 1 all atom 50000 dump.*.lammpstrj
run 1200000
#unfix 1
#fix 1 all npt temp $x 2000 4.00 iso 0 0 1000
#compute 3 all pe/atom
#compute 4 all ke/atom
#run 1200000
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1楼 2015-05-18 11:44:32
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fengliu

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以把时间步调小一个数量级试试，你的时间大了,改成1fs或者0.1fs.
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2015-06-16 09:31:56
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普通回帖

18865279707

金虫 (正式写手)
★
MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
不懂

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2015-05-18 12:27:43
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超级大怪兽

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，请问问题解决了么，我也遇到这个问题了，想请教一下，谢谢
赞一下 回复此楼
8楼2016-01-21 11:15:03
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仙道彰

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主最后怎么解决的呢？
赞一下 回复此楼
9楼2016-03-29 22:26:16
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向上吧123

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主怎么解决的 我也遇到了原子丢失

发自小木虫IOS客户端
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10楼2017-04-17 19:31:04
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牛很牛

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同样的问题，怎么解决的呀
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11楼2019-05-06 10:21:43
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LifePursuit3楼
2015-05-18 12:28   回复  
MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
dmbb4楼
2015-05-19 18:28   回复  
MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
沐-浅夏5楼
2015-05-19 18:32   回复  
MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
shenrenren6楼
2015-05-19 18:33   回复  
MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
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