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MR_LeeDD

新虫 (初入文坛)


[交流] Lammps计算SiO2熔点,原子丢失错误

  是用Materials Studio 6.0建模导出data文件然后读取,看到有人说是data文件的问题,换了好几个还是一样的结果,导师给我一个现成的data文件还是一样的错误,ERROR: Lost atoms: original 2663 current 2509 (../thermo.cpp:401)
我觉得是in文件出错,in文件编的很简单,各位大神看看需要怎么改?
units metal
boundary p p p
atom_style full
variable x equal 2.5
read_data   data.emd

timestep 0.01
thermo 1000
pair_style          tersoff
pair_coeff           * * SiO.tersoff Si O

neighbor 0.5 bin
neigh_modify every 5 delay 0 check yes

#velocity all create $x 825577 dist gaussian
fix 1 all nvt temp $x 2000 1.0
dump 1 all atom 50000 dump.*.lammpstrj
run 1200000
#unfix 1
#fix 1 all npt temp $x 2000 4.00 iso 0 0 1000
#compute 3 all pe/atom
#compute 4 all ke/atom
#run 1200000
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超级大怪兽

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,请问问题解决了么,我也遇到这个问题了,想请教一下,谢谢
8楼2016-01-21 11:15:03
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查看全部 11 个回答

18865279707

金虫 (正式写手)



MR_LeeDD(金币+1): 谢谢参与
不懂

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-05-18 12:27:43
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fengliu

铁杆木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以把时间步调小一个数量级试试,你的时间大了,改成1fs或者0.1fs.
7楼2015-06-16 09:31:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

仙道彰

银虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主最后怎么解决的呢?
9楼2016-03-29 22:26:16
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