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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » discover 能量最小化问题
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409702500

银虫 (著名写手)

[求助] discover 能量最小化问题

具体情况是：建了一个聚合物链，然后能量最小化了一下，设了20万步，但好几次运行到10几万步就自己结束了，显示是计算成功了，请问各位这是什么个情况呢？是成功了呢，还是出来什么问题呢？

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[ 来自科研家族 计算材料学 ]
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1楼 2012-11-29 12:29:37
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sesea7

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
409702500: 金币+6, ★有帮助 2012-11-29 20:04:57
为什么觉得有问题呢？要是达到收敛标准就可以了，一般不会错的
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喵星人
2楼2012-11-29 12:50:28
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409702500

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sesea7 at 2012-11-29 12:50:28
为什么觉得有问题呢？要是达到收敛标准就可以了，一般不会错的

您好，您觉得收敛标准时什么呢，是软件显示"successful"了吗？
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3楼2012-11-29 15:27:00
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sesea7

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-30 09:19:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by 409702500 at 2012-11-29 15:27:00
您好，您觉得收敛标准时什么呢，是软件显示"successful"了吗？...

你开始跑minimize的时候有个convergence level，需要选择。coarse、medium等等代表多少算收敛，就看看help，里面有详细内容，还可以自己设定算到两步之间的力大小变化小于多少的时候计算完成。软件计算两步之间的变化小于这个值就显示successful
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喵星人
4楼2012-11-29 17:20:55
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loveben

铜虫 (小有名气)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-30 09:19:47
迭代到步间差小到一定值就会停了，跟你设置有关，具体到体系是否达到真实值就不一定了，需要用物性来判断，比如密度啊等等
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409702500
5楼2012-11-29 18:44:24
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409702500

银虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by loveben at 2012-11-29 18:44:24
迭代到步间差小到一定值就会停了，跟你设置有关，具体到体系是否达到真实值就不一定了，需要用物性来判断，比如密度啊等等

6楼2012-11-29 20:05:47
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个是因为设置了程序终止的标准，达到标准就会自己结束的，标准包括很多，比如两步的能量差小于某个值，或者力小于某个值
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壁立万仞，无欲则刚
7楼2012-11-30 09:20:57
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