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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 30金币求助一个A类和一个B类错误
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yaocumt

木虫 (正式写手)

[求助] 30金币求助一个A类和一个B类错误

错误提示如下：
916_ALERT_2_A Hooft y and Flack x Parameter values differ by .       1.00
#==============================================================================
111_ALERT_2_B ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         87 PerFi，
晶体为纯有机化合物，仅含C，O，N，H，无重原子，钼靶，XPrep给出空间群P21/m，wingx给出空间群P21，但只有P21空间群可以解析，且platon不能提升空间群，给出信息如图示。
望高手指点如何消除这两个错误，或者如何才能确定绝对构型，非常感谢！

1.jpg
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1楼 2012-11-20 19:28:16
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将数据贴上来我给你看看，你的结构里没有重于Si的原子，用Mo靶不能确定却对构型。不过我估计你的空间群应该是P2(1)/m，至于Platon给不出结果，可能是你的结构还没解出来。
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yaocumt
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2012-11-21 00:47:40
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1 platon只有在结构解析完成后才用于提升空间群。
2、结构中有无溶剂分子存在降低了对称性
3、结构中是否有侧链部分原子无序造成了对称性降低。
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yaocumt
北京人
3楼2012-11-21 08:33:56
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yaocumt

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2012-11-21 00:47:40
将数据贴上来我给你看看，你的结构里没有重于Si的原子，用Mo靶不能确定却对构型。不过我估计你的空间群应该是P2(1)/m，至于Platon给不出结果，可能是你的结构还没解出来。

谢谢您的回复，不过结构中仅含Ｃ，Ｈ，Ｎ，Ｏ，并且结构已经完整解析，Ｑ峰小于０．３。
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4楼2012-11-21 13:29:29
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yaocumt

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaochong98 at 2012-11-21 08:33:56
1 platon只有在结构解析完成后才用于提升空间群。
2、结构中有无溶剂分子存在降低了对称性
3、结构中是否有侧链部分原子无序造成了对称性降低。

谢谢您的回复，不过结构已经完整解析，Ｑ峰小于０．３，并且不含溶剂分子无无序组分。
不过还是向您请教，如果有溶剂分子或者无序组分存在导致了对称性降低，那么Ｐ２１空间群是否正确？
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5楼2012-11-21 13:34:45
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

如果结构已经完整解析，Ｑ峰小于０．３，并且不含溶剂分子无无序组分。
那有一种可能就是，两分子的构想存在差异，建议你用dtmm软件将将两个分子叠一下，看看能否完全重叠。
至于你问的第二个问题，P21是手性空间群，晶胞中只含有一种手性分子，而P21/m是中心对称空间群，晶胞中两种构型的分子都有。（1)如果分子的手性一致，由于溶剂介入降低对称性，那么P21就是正确的。（2)如果由于原子无序造成的对称性降低，那P21/m的空间群正确。
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北京人
6楼2012-11-21 13:51:52
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