| 查看: 3322 | 回复: 13 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
细菌种属的鉴定（系统发育树）--急用
|
||
我对筛选的一个菌的16SrRNA测序后，然后建了个系统发育树，但是我的菌在树根的最枝头上（如图），请问这这个菌的种属怎么确定啊？谢谢！ 14.jpg  14-2.jpg [ Last edited by moucheng on 2012-11-20 at 10:56 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂
已经有3人回复
-
285求调剂
已经有6人回复
-
材料求调剂
已经有3人回复
-
288求调剂
已经有6人回复
-
复试调剂
已经有12人回复
-
计算机11408，286分求调剂
已经有3人回复
-
材料专硕322分
已经有8人回复
-
一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业083200
已经有5人回复
-
081200-11408-276学硕求调剂
已经有5人回复
-
材料调剂
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 培养基上培养的细菌菌落鉴定
已经有11人回复
- 细菌鉴定：16SrDNA能否鉴定到种？
已经有12人回复
- 求助关于土壤细菌分离鉴定的知识，希望朋友帮忙解答
已经有8人回复
- 鉴定细菌种（不是属）的生物学方法有哪些
已经有27人回复
- API技术鉴定细菌到种
已经有9人回复
- 关于筛选和鉴定细菌(16S rRNA)
已经有35人回复
- 【求助/交流】哪里可以做细菌菌种鉴定？
已经有16人回复
- 【求助/交流】细菌鉴定
已经有14人回复
- 【求助/交流】16s进化树+细菌鉴定 达人 请进~~~
已经有5人回复
zqp9110
金虫 (正式写手)
- 应助: 42 (小学生)
- 金币: 2144.5
- 散金: 9
- 红花: 4
- 帖子: 528
- 在线: 118.4小时
- 虫号: 997891
- 注册: 2010-04-16
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
6楼2012-11-21 22:31:02
andywang6137
木虫 (著名写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1552.5
- 散金: 309
- 红花: 25
- 帖子: 1651
- 在线: 460.3小时
- 虫号: 607807
- 注册: 2008-09-20
- 专业: 食品加工技术
2楼2012-11-20 16:29:02
莲池梵音
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1605.1
- 散金: 15
- 红花: 4
- 帖子: 299
- 在线: 26小时
- 虫号: 820447
- 注册: 2009-08-02
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
moucheng: 金币+3, ★有帮助, 谢谢！ 2012-11-20 23:03:55
zhang8826857: 金币+3, good 2012-11-24 16:34:28
感谢参与，应助指数 +1
moucheng: 金币+3, ★有帮助, 谢谢！ 2012-11-20 23:03:55
zhang8826857: 金币+3, good 2012-11-24 16:34:28
|
单纯从你的树来看：1外群还有很多选择可改进，2 内群有点稍微盲目了，从你选的种类来看，种类多且都是每个种一个序列，这样固然可以增加种类丰度，但是在建树时却不利形成有效分枝。建议可以选择与Bicallus同一个科内的属或者其他作为外群；内群上每一个种尽量大于一个序列，其次根据相似性，几个有代表性的种，并不是种类越多越好。 PS： 请问你在NCBI进行相似性比对后 有相似性100%或者说大于97%以上的吗？如果有又是什么种类，是哪些种类？这样应该对你确定它是什么 有参考. |
3楼2012-11-20 22:15:01
4楼2012-11-20 23:09:17
10