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newscat1993木虫 (小有名气)
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PDB文件预处理
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从protein data bank获得的PDB文件，在进行tleap加氢之前应该具体怎么样进行预处理？我想手动通过notepad进行预处理。从资料来看需要把HIS改成HIE或者HID或者HIP，CYS改成CYX，还有将HETATM，CONNECT部分删除，还有别的要补充修改的吗？ 预处理结束的文件在进行AMBER模拟之前是不是一定要minimization一下？能否直接heat？ |
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 amber |
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zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-17 15:48:27
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-17 15:48:27
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7楼2012-11-17 12:25:14
whzwcm
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2楼2012-11-14 22:09:15
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5楼2012-11-16 23:33:18
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6楼2012-11-16 23:46:30
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8楼2012-11-26 16:12:31
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9楼2012-11-26 16:52:37
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10楼2012-11-28 10:00:28