应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 给你一个序列，从生物信息学角度描述你的分析思路
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
131/1返回列表
查看: 2147  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

avhg

木虫 (著名写手)

[交流] 给你一个序列，从生物信息学角度描述你的分析思路

我想这是一个较为全关的问题，期待各位大牛描述下自己的分析流程思路，大家交流讨论~
给你一个蛋白质序列，从生物信息学角度，你的分析思路如何呢？从哪些方面作关于这一个序列的分析呢？
给你一个基因序列呢？

[ 来自科研家族 哲学人生 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

科技

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-10-23 13:18:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

匿名

用户注销 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
avhg: 金币+5, 可否纵向描述一下呢？感谢不吝赐教。。。。 2012-10-23 22:58:26
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2012-10-23 21:37:58
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
普通回帖

scelab

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★ ★ ★ ★
avhg: 金币+5, 版主，你给点力啊，就打这几个字。。 2012-10-23 21:28:46
功能。。。。
回复此楼
2楼2012-10-23 13:51:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aloon111

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
avhg: 金币+5, 欢迎进一步细化思路 2012-10-23 21:28:08
功能，同源性，预测结构
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-23 14:10:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

avhg

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aloon111 at 2012-10-23 14:10:58
功能，同源性，预测结构

其实我也知道是这几个方面，就是实施起来可能就不知道具体流程了。。。
赞一下 回复此楼
4楼2012-10-23 21:27:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永远不知道

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看天: 金币+5, 鼓励交流 常来 2012-10-24 19:34:43
avhg: 金币+3, 受教。 2012-10-25 21:09:10
首先，要确定序列是谁的，其次，要预测该蛋白序列的理化性质，氨基酸含量，再次，要知道蛋白的结构预测，第四，要分析同源性，构建进化树，第五，综合前面要预测该蛋白的功能或者与功能相适应的分析，基本这些，谢谢
赞一下 回复此楼
6楼2012-10-24 00:21:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看天: 金币+4, 鼓励回答 2012-10-24 19:34:56
avhg: 金币+4, 受教。 2012-10-25 21:08:52
这个范围太广了，看你的目的如何。
说点不常见的，给个蛋白序列，可以从序列本身来预测该蛋白在质谱上的表现，选择哪个多肽来定量。
最常见的就是BLAST，进一步可以分析保守序列，研究进化历史，预测二级三级结构，会不会与别的分子（比如说糖，金属离子）结合，能不能做药物靶点，代谢作用等
赞一下 回复此楼
7楼2012-10-24 03:35:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你为什么给我一个序列？
赞一下 回复此楼
8楼2012-10-24 05:33:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lizs8023

银虫 (正式写手)
围观一下
回复此楼
9楼2012-10-24 08:30:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

章信来

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看天: 金币+4, 好强大 2012-10-24 19:36:02
avhg: 金币+4, 受教。 2012-10-25 21:09:56
的确有点泛！
我想一般首先鉴定下到底是啥，先肯定blast下，基因的话就找出mRNA和氨基酸序列（这里也有很多可能，比如是基因组没有mRNA的话，需要先预测，该基因是否有可变剪切（AS），是不是含有多态位点（SNP），基因结构分析啥的），氨基酸序列基本就是那几个分析，一级、二级、三级和四级分析，外加蛋白修饰，GO、pathway和进化树分析啥的，一通鉴定之后基本上功能也就分析个八九不离十了，之后验证的事就交给实验了。估计一般情况不会用到全套的分析！
赞一下 回复此楼
11楼2012-10-24 11:17:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

莎莎加油

木虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
首先进行比对看看序列属于什么物种 具体的定位。接下来做功能注释，保守结构，找在其他物种中有没有同源序列 ，再看有没有三级结构。可以找到对应的编码基因。对基因做功能注释等等。就只了解这些了。
赞一下 回复此楼
12楼2012-11-11 11:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可可乐乐

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
路过，感兴趣，看看！顶
赞一下 回复此楼
13楼2012-11-24 21:25:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
郑克宁10楼
2012-10-24 09:16   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 avhg 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 336材料与化工085600求调剂 +7 水星记infp 2026-04-05 7/350 2026-04-06 00:57 by fmesaito
[考研] 一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂 +4 Mr. Z 2026-04-05 4/200 2026-04-06 00:51 by fmesaito
[考研] 调剂 +5 好好读书。 2026-04-01 5/250 2026-04-05 17:54 by liucky
[考研] 0860 求调剂 一志愿国科大 348 分 +3 WiiiP 2026-04-03 3/150 2026-04-05 17:43 by Ecowxq666！
[考研] 284求调剂 +7 徐同学_001 2026-04-04 13/650 2026-04-05 17:19 by yulian1987
[考研] 313求调剂 +5 海日海日 2026-04-04 5/250 2026-04-05 15:52 by jndximd
[考研] 0703化学调剂325分 +9 15771691647 2026-04-04 9/450 2026-04-05 11:39 by 猪会飞
[考研] 考研调剂 +3 mcbbc 2026-04-04 3/150 2026-04-05 10:03 by barlinike
[考研] 324求调剂 +14 想上学求调 2026-04-02 15/750 2026-04-04 20:31 by 无际的草原
[考研] 0835学硕299求调剂 08大类可接受 +5 useryy 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:07 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿0817化学工程与技术，求调剂 +24 我不是只因 2026-04-02 28/1400 2026-04-04 15:15 by dongzh2009
[考研] 求调剂，一志愿北京中医药大学 +3 小小达不溜 2026-04-02 3/150 2026-04-03 22:55 by 冲矢昴星团
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 08工科275分求调剂 +14 AaAa7420 2026-03-31 14/700 2026-04-03 11:13 by cocolv
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-04-02 3/150 2026-04-03 08:44 by yulian1987
[考研] 362求调剂 +14 西南交材料专硕3 2026-03-31 14/700 2026-04-02 17:50 by yunlongyang
[考研] 348求调剂 +11 zzzzyk123 2026-04-01 11/550 2026-04-02 16:52 by Wang200018
[考研] 化学工程专硕324分，一志愿中国矿业大学求调剂 +7 耿耿1314 2026-04-01 7/350 2026-04-02 07:40 by 尚水阁主
[考研] 一志愿大连理工大学，机械工程学硕，341 +3 西瓜田的守望者 2026-03-30 3/150 2026-03-31 11:08 by asdfzly
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭