应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于内坐标的问题
71/1返回列表
查看: 1751  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

feynman1965

金虫 (正式写手)

[求助] 关于内坐标的问题

#T RHF/6-31G(d) Opt Test

Ethylene Geometry Optimization

0 1
C
C 1 CC
H 1 CH 2 HCC
H 1 CH 2 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 4 180.
      Variables:
CC=1.31
CH=1.07
HCC=121.5
这种坐标写法，怎么和说明书上的直角和内坐标写法都不一样？怎么理解？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯理论相关知识 高斯/MOPAC Gaussian

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-13 22:10:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

chenggong2008

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
feynman1965: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-12-09 13:18:45
feynman1965: 回帖置顶 2012-12-09 13:18:47
这个问题，我也关注了很久，最近终于看明白了，且听我仔细分析。

首先，原子编号的问题，以这个乙烯为例。原子共有6个原子，每行开头那个原子对应1、2、3、4、5、6号原子。内坐标的三要素就是键长、键角、二面角。
举例分析：
C
C 1 CC
H 1 CH 2 HCC
H 1 CH 2 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 4 180.
上面的第6行：H 2 CH 1 HCC 4 180是什么意思呢？
表示第6个原子，接在第二个碳原子上，对应的C-H键长的变量为CH，实质就是6号H原子与2号碳原子的键长。这行里的HCC表示一个角，角指6号H-2号C-1号C组成的夹角，顶点为2号碳原子。简单表示，就是6-2-1组成的角度。该行的180度，表示6-2-1-4号原子组成的二面角，二面角的相交线在2-1号原子的连线上。这样解释看大家明白没有？
赞一下(3人) 回复此楼
7楼2012-12-08 13:11:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
feynman1965: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-14 16:34:16
这个就是标准内坐标，CC和CH是两个长度，HCC是角度。这种写法的好处是减少了变量数目，这种写法利用了分子的对称性，通过将应该相等的2个变量用1个变量表示，把9个变量简化成了3个变量。这种写法有两个好处：1、保持了严格的分子对称性，2、节省了计算时间。同时要指出的是上述内坐标中的那3个180其实也是变量，也就是说这个内坐标体系中一共有6个变量。如果直接将CC、CH和HCC用各自数值替换，则表示是12个变量。
赞一下(1人) 回复此楼
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=雨晨田木&say=不要太辛苦哦。[/img][/url]
2楼2012-10-14 16:31:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feynman1965

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 雨晨田木 at 2012-10-14 16:31:00
这个就是标准内坐标，CC和CH是两个长度，HCC是角度。这种写法的好处是减少了变量数目，这种写法利用了分子的对称性，通过将应该相等的2个变量用1个变量表示，把9个变量简化成了3个变量。这种写法有两个好处：1、保持 ...

你好，谢谢你的回答！那个C 1 CC
中的1指什么？能不能简单说下这一行表示的意思？谢！
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-14 16:35:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wang_dan1990

木虫 (小有名气)

风筝

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
C1指的是编号为1的C原子
赞一下 回复此楼
4楼2012-10-15 08:37:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wang_dan1990

木虫 (小有名气)

风筝

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
feynman1965: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-15 09:10:05
我得到的这个坐标的意思是：将第一行C认为是1号C原子，第二行的C是第二号C原子，第二行的C1 CC是指，第二号C原子与编号为1 的CC键 键长。H 1 CH 2 HCC 表示H与1号C原子的键长CH，以及C1，C2的夹角H-C-C。
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-15 08:51:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feynman1965

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wang_dan1990 at 2012-10-15 08:51:52
我得到的这个坐标的意思是：将第一行C认为是1号C原子，第二行的C是第二号C原子，第二行的C1 CC是指，第二号C原子与编号为1 的CC键 键长。H 1 CH 2 HCC 表示H与1号C原子的键长CH，以及C1，C2的夹角H-C-C。

谢谢你的回答！！
H 1 CH 2 HCC 3 180
这里面的3怎么理解？这个180是哪个二面角？这个文件是在高斯安装里的example里的文件，不知道在那能找到关于这种写法的说明！说明书里好像没有！
赞一下 回复此楼
6楼2012-10-15 09:11:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 feynman1965 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +4 niko- 2026-03-22 4/200 2026-03-23 07:56 by Iveryant
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +7 自由煎饼果子 2026-03-16 7/350 2026-03-22 22:40 by ACS Nano——
[考研] 263求调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 4/200 2026-03-22 21:20 by 1144970272
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂 +3 jiajunX 2026-03-22 3/150 2026-03-22 19:32 by brblmd
[考研] 293求调剂 +12 zjl的号 2026-03-16 17/850 2026-03-22 16:51 by i_cooler
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂 +12 yangfz 2026-03-17 12/600 2026-03-21 03:30 by JourneyLucky
[考研] 271材料工程求调剂 +8 .6lL 2026-03-18 8/400 2026-03-21 00:58 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭