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feynman1965金虫 (正式写手)
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关于内坐标的问题
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#T RHF/6-31G(d) Opt Test Ethylene Geometry Optimization 0 1 C C 1 CC H 1 CH 2 HCC H 1 CH 2 HCC 3 180. H 2 CH 1 HCC 3 180. H 2 CH 1 HCC 4 180. Variables: CC=1.31 CH=1.07 HCC=121.5 这种坐标写法，怎么和说明书上的直角和内坐标写法都不一样？怎么理解？ |
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这个问题，我也关注了很久，最近终于看明白了，且听我仔细分析。 首先，原子编号的问题，以这个乙烯为例。原子共有6个原子，每行开头那个原子对应1、2、3、4、5、6号原子。内坐标的三要素就是键长、键角、二面角。 举例分析： C C 1 CC H 1 CH 2 HCC H 1 CH 2 HCC 3 180. H 2 CH 1 HCC 3 180. H 2 CH 1 HCC 4 180. 上面的第6行：H 2 CH 1 HCC 4 180是什么意思呢？ 表示第6个原子，接在第二个碳原子上，对应的C-H键长的变量为CH，实质就是6号H原子与2号碳原子的键长。这行里的HCC表示一个角，角指6号H-2号C-1号C组成的夹角，顶点为2号碳原子。简单表示，就是6-2-1组成的角度。该行的180度，表示6-2-1-4号原子组成的二面角，二面角的相交线在2-1号原子的连线上。这样解释看大家明白没有？ |
7楼2012-12-08 13:11:50
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