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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【求助】请问大家平时都是如何构建分子的内坐标
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请问大家平时都是如何构建分子的内坐标 已有3人参与

小弟在建立输入文件时，感觉建分子的内坐标比较繁冗尤其是对于较大的体系。我一般是用GV建但是GV建的坐标的格式不对要修改。想请教大家平时是如何简单迅速的建立分子的内坐标的？希望大家不吝指教！
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1楼 2010-12-19 14:43:47
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ykwang

金虫 (正式写手)
要么自己写程序去做，要么先给出直角坐标然后用GaussView转换为内坐标。
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Nothing_Is_Impossible!
2楼2010-12-19 17:43:25
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-19 17:43:25:
要么自己写程序去做，要么先给出直角坐标然后用GaussView转换为内坐标。

哦，但是GV转换出来的内坐标需要自己调整列的顺序。
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3楼2010-12-19 19:00:01
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
一般计算的都比较小，没有楼主遇到的问题，不过如果真的是大型的分子，可以借助别的软件，一些计算生物体系，或者聚合物之类的，比如手性固定相计算的工作，我见过，能有很大的体系，如果那些有楼主需要的输入形式，可以考虑简单学一下~
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4楼2010-12-19 19:04:22
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