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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请问大家平时都是如何构建分子的内坐标 已有3人参与

小弟在建立输入文件时,感觉建分子的内坐标比较繁冗尤其是对于较大的体系。我一般是用GV建但是GV建的坐标的格式不对要修改。想请教大家平时是如何简单迅速的建立分子的内坐标的?希望大家不吝指教!
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ykwang

金虫 (正式写手)

要么自己写程序去做,要么先给出直角坐标然后用GaussView转换为内坐标。
Nothing_Is_Impossible!
2楼2010-12-19 17:43:25
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-19 17:43:25:
要么自己写程序去做,要么先给出直角坐标然后用GaussView转换为内坐标。

哦,但是GV转换出来的内坐标需要自己调整列的顺序。
3楼2010-12-19 19:00:01
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一般计算的都比较小,没有楼主遇到的问题,不过如果真的是大型的分子,可以借助别的软件,一些计算生物体系,或者聚合物之类的,比如手性固定相计算的工作,我见过,能有很大的体系,如果那些有楼主需要的输入形式,可以考虑简单学一下~
4楼2010-12-19 19:04:22
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