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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 两次测序结果差几个碱基可以吗？
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zqt123_1981

木虫 (小有名气)

[交流] 两次测序结果差几个碱基可以吗？ 已有5人参与

根据第一次的测序结果，EST拼接后延伸了一段序列，测序结果出来对比原先的核心序列，有2个位点碱基不对，有2个位点2个碱基缺失，结果可以吗？
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1楼 2012-10-08 08:27:56
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gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”
★
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你将其翻译成蛋白，看一下是否还有保守结构域，有的应该是正确的！
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持之以恒、永不放弃！
2楼2012-10-08 09:58:52
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btx362237729

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
缺两个不就有移码突变了
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人生最黑暗的时光终于过去了
3楼2012-10-08 12:36:48
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-09 15:53:23
你是要做表达吗？这样不行的。先看看不一样的地方的峰图。在测序质量差的地方有可能是识别错误或者缺失，需要手动识别。如何测序结果很肯定的话，把它翻译成蛋白，如果有移码或者中间有终止密码子就肯定不行了。如果是silent mutation的话，只要新的密码子不是稀有密码子的话还是可以用的。
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4楼2012-10-08 14:23:13
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老五

木虫 (著名写手)
好高深的说，完全不懂
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为人民服务！
5楼2012-10-08 15:21:14
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer
★
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两次测序结果差几个碱基，是哪个位置差的？目的片段？在测序单子上是第几个碱基？
测序时，由于荧光染料的干扰，测序结果在引物3'端后面的10至30个，严重时可能达到70个以上碱基不一定能够准确判读，需根据自己的已知序列信息及测序彩图作出判断.
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Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
6楼2012-10-09 15:29:04
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