24小时热门版块排行榜    

查看: 4297  |  回复: 9

laohu314422

铜虫 (小有名气)

[求助] VASP怎样计算水分子键长 键角

首先简单说一下,我知道怎样计算直线型分子的键长,比如H2,先构建超晶胞,然后就是固定其中一个原子在坐标原点,改变另一个的位置就行,因为是直线型,所以容易做,但现在是H2O,有键角,不容易做。我的初步想法是固定O在原点,两个H对称的,但是又牵扯到角度和距离都在变化,就不知道POSCAR里面该怎样做了,不知道各位做过没,看似简单的东西,要想搞出来还真不容易,我的导师让我做一下,我想了很长时间,不知道该怎样在POSCAR里摆,希望各位不吝赐教啊。灌水勿扰啊,真诚感谢,如果我有什么地方说的不清楚,欢迎指教啊,我们可以认真谈论一下!!!谢谢各位啊!!!!!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangll99

木虫 (职业作家)

建个超胞,百度google一个大概值,建好模型,结构优化,计算键长键角。。。。
2楼2012-09-29 09:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教! 2012-09-29 18:13:48
如果只是想验证下,先找个水分子的结构,然后优化。
接下来改变下角度啊,距离,再优化,看能不能对上理论值
timeflies..
3楼2012-09-29 11:08:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖! 2012-09-29 18:21:52
建一个大盒子,O放中间,H放两边,比O略低/高均可,O-H键长大约0.98A,键角有一百零几度吧,算一下投影到与O同高时,垂足到O的距离,换算一下就出来了....
譬如:
0.5   0.5  0.5   --->O
0.5-x  0.5  0.5-z   --->H
0.5+x  0.5  0.5-z  --->H

根据你盒子大小,确定一下x,z就可以了。盒子边长应不低于10A....
4楼2012-09-29 11:48:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanarsenal

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-09-30 18:36:15
H2O的问题是非常复杂的,北大的Wang Enge有很多这方面的文章,可以去看一下,给个链接你
http://engewang.iphy.ac.cn/index.php?page=enge-wang
5楼2012-09-29 12:45:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

魔鬼中的天使

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教! 2012-09-29 18:25:41
水的问题确实复杂
不过处理一个单分子的话vasp我猜还是应付的来的
或是试试gauss来算?它这方面应该可以做得更准确些
6楼2012-09-29 14:51:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanarsenal

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 魔鬼中的天使 at 2012-09-29 14:51:00
水的问题确实复杂
不过处理一个单分子的话vasp我猜还是应付的来的
或是试试gauss来算?它这方面应该可以做得更准确些

问题是能确定水分子是周期性排列的吗?最小周期是多少,一个分子的计算要比晶体的计算困难多了…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2012-10-01 09:48:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

魔鬼中的天使

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by fanarsenal at 2012-10-01 09:48:14
问题是能确定水分子是周期性排列的吗?最小周期是多少,一个分子的计算要比晶体的计算困难多了…
...


单分子当然是留出真空层
8楼2012-10-01 21:18:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

707462558

银虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huangll99 at 2012-09-29 09:40:28
建个超胞,百度google一个大概值,建好模型,结构优化,计算键长键角。。。。

计算键长键角怎么做的
无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
9楼2013-01-06 11:06:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红尘不到

铜虫 (小有名气)

楼主现在解决了么?请问是怎么弄的?
10楼2015-05-18 15:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 laohu314422 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了 +10 wuchongjun 2026-08-20 13/650 2026-08-20 16:22 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +17 基诺咪客 2026-08-17 21/1050 2026-08-20 14:54 by 昝占全2025
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +16 Ldrop2023 2026-08-13 20/1000 2026-08-20 11:07 by xskun
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 21/1050 2026-08-20 10:37 by Vivilian
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见