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denis2008

金虫 (正式写手)

[求助] 求助perl程序

各位编程高手，你们好，我目前刚学perl编程，现要编一个小程序，感觉有点困难，请求各位帮忙。
数据如下：
code1
CGTCTCGATc
TGCGCCGAGc
AACACTGGGc
CCCTGGGTCc
TACGTTTCAc
TGACGTGCAc
code2
AAAACAGGGc
CCGGGCTTGc
TAAATAGTTc
TACATCTTCc
code 3
GATC
ATCG
CGTA
输出格式：
code3+GGCACATTGATTTGGGAGTc+code1+code2+AGATCTGATGGCGCGAGGG
以及此序列的互补序列，分别输出到两个不同的文件中。
谢谢各位大侠帮忙！
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洗烧杯只是我的表面工作，其实我是研究僧。
1楼 2012-09-28 14:28:01
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mycaas

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没看懂要做什么 code是代表序列还是只是简单的字符？
互补序列 tr reverse下就可以
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2楼2012-09-28 16:07:04
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denis2008

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mycaas at 2012-09-28 16:07:04
没看懂要做什么 code是代表序列还是只是简单的字符？
互补序列 tr reverse下就可以

code代表的是它下面列出的各条序列。
赞一下 回复此楼
洗烧杯只是我的表面工作，其实我是研究僧。
3楼2012-09-29 09:16:47
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scbible

木虫 (正式写手)

EPI the king of water
几年没用，忘记了，爱莫能助哈
赞一下 回复此楼
个人BLOG:http://www.eoe.so
4楼2012-10-17 13:00:30
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木有鱼丸

铁杆木虫 (知名作家)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

#!usr/bin/perl
open(IN1,"E:\\code1.txt"||die"can't open the file:$!";
open(IN2,"E:\\code2.txt"||die"can't open the file:$!";
open(IN3,"E:\\code3.txt"||die"can't open the file:$!";
open(OUT1,">E:\\positive.txt"||die"can't open the file:$!";
open(OUT2,">E:\\negtive.txt"||die"can't open the file:$!";
$file1="GGCACATTGATTTGGGAGTC";
$file2="AGATCTGATGGCGCGAGGG";
@file1=split(//,$file1);
@file2=split(//,$file2);
foreach(@file1)
{
        if($_ eq "A"
        {
                $file3[$m]="T";
                $m++;
                }
                if($_ eq "T"
        {
                $file3[$m]="A";
                $m++;
                }
                if($_ eq "G"
        {
                $file3[$m]="C";
                $m++;
                }
                if($_ eq "C"
        {
                $file3[$m]="G";
                $m++;
                }
        }
        foreach(@file3)
        {
                $file3=$file3.$_;
                }
        foreach(@file2)
{
        if($_ eq "A"
        {
                $file4[$n]="T";
                $n++;
                }
                if($_ eq "T"
        {
                $file4[$n]="A";
                $n++;
                }
                if($_ eq "G"
        {
                $file4[$n]="C";
                $n++;
                }
                if($_ eq "C"
        {
                $file4[$n]="G";
                $n++;
                }
        }
                foreach(@file4)
        {
                $file4=$file4.$_;
                }
while(
{
        chomp($_);
        $code=$_;
        $code1=$code1.$_;
        }
        while(
{
        chomp($_);
        $code2=$code2.$_;
        }
                while(
{
        chomp($_);
        $code3=$code3.$_;
        }
print OUT1 "$code3$file1$code1$code2$file2\n";
print "$code3$file1$code1$code2$file2\n";
print OUT2 "$code3$file3$code1$code2$file4\n";
print "$code3$file3$code1$code4$file2\n";
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你问我姓什么？姓章，章鱼丸。骗人？别逗了，我真姓章。。
5楼2012-10-22 21:46:40
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木有鱼丸

铁杆木虫 (知名作家)
)
6楼2012-10-22 21:48:21
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木有鱼丸

铁杆木虫 (知名作家)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
denis2008: 金币+10, ★有帮助 2012-10-23 11:20:58
我被小木虫打败了。那个表情是一个右括号。。。
赞一下(1人) 回复此楼
你问我姓什么？姓章，章鱼丸。骗人？别逗了，我真姓章。。
7楼2012-10-22 21:48:41
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denis2008

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 木有鱼丸 at 2012-10-22 21:48:41
我被小木虫打败了。那个表情是一个右括号。。。

谢谢你哈
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洗烧杯只是我的表面工作，其实我是研究僧。
8楼2012-10-23 11:20:46
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