24小时热门版块排行榜    

查看: 4146  |  回复: 4
【悬赏金币】回答本帖问题,作者古韵清音将赠送您 11 个金币

古韵清音

银虫 (小有名气)

[求助] qRT-PCR的数据处理问题,error bar应该怎么做?

我的实验是去医院收样本来做的,一次收不了几个,所以用荧光PCR做相对定量只能分很多次做,这样我要最后把数据集中起来就没有办法直接用仪器给出的图表,而且有些数据我也还要筛选一下。
现在我想自己把数据整出来之后用excel或者graphpad之类来做柱状图,但是现在不知道error bar应该怎么做,我仔细看了下仪器的分析结果,好像它的error bar用的是RQ max和RQ min,所以请问一下,这里的error bar难道不是用SD么?我的SD是用目的基因CT减去内参CT之后的值计算的,高的时候有0.23。但是用SD的话,因为柱状图的高度是2-△△CT,所以直接用SD的话会出现比如柱高是0.02但error bar有0.23左右,我觉得不大对啊,想请问下各位牛人,这个数据到底是怎么处理的?

[ Last edited by 古韵清音 on 2012-9-9 at 23:41 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xw19880905

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-09-11 16:02:48
古韵清音: 金币+5, 有帮助, 后来看到一篇文献。。。现在搞清楚了 2012-09-12 16:50:25
是用SD计算,但是我觉得你操作中是不是两个概念混淆了,因为算SD时也要先算出-△△CT值,在算出2-△△CT,再才计算SD值,你试试看,是不是这不没做?
2楼2012-09-11 10:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-09-11 16:03:00
古韵清音: 金币+4, 有帮助, 但是我看到的文献是,最后的error bar还要用power(2,-a)的SD值再除以一个作为对照的样本的power(2,-a) mean 2012-09-12 16:52:46
我们处理数据的时候也是用基因CT减去内参CT,然后我们算值是用EXCEL里的公式算的--power(2,-a),然后再用三组这个值来做ERROR BAR,EXCEL可自动生成。
希望实验能顺利!
3楼2012-09-11 15:54:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得你可能就是没弄清楚用哪个做ERROR BAR吧,如果只是结果不理想,那就是你的数据偏差较大!
持之以恒、永不放弃!
4楼2012-09-11 17:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
SD和SE不是一回事,SD=STDEV, 而SE=STANDARD ERROR, SD=SE/SQRT(X), X=样品数。
5楼2012-09-11 19:04:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 古韵清音 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 三个手稿 10+5 s爱吃芒果 2024-12-22 9/450 2024-12-23 16:32 by 世界之源
[职场人生] 国企、民企行业不同,如何决择? +10 haihe623 2024-12-19 12/600 2024-12-23 16:02 by syl200707
[教师之家] 如果评职称不需要国家自然基金,还会有人去申请吗? +3 akslis2024 2024-12-19 3/150 2024-12-23 16:00 by syl200707
[硕博家园] 只想摆烂 +7 s150535912 2024-12-23 9/450 2024-12-23 15:17 by hzwdzdf
[文学芳草园] 生活的意义 +5 宋昙 2024-12-20 5/250 2024-12-23 14:37 by yuan0806
[找工作] 柔引引进博士硕士。 +21 大发财树 2024-12-18 22/1100 2024-12-23 09:32 by Demo呆萌
[论文投稿] 挑数据是造假吗 +9 电话的建设 2024-12-21 9/450 2024-12-23 08:55 by Xmc_金虫
[论文投稿] International Journal of Biological Macromolecules 10+3 123smiles 2024-12-22 4/200 2024-12-23 08:23 by 北京莱茵润色
[硕博家园] 读研之后发现: 圈子变得越来越小了... +13 丁柯翔鸭 2024-12-19 18/900 2024-12-22 23:06 by 丁柯翔鸭
[功能材料] 请教大神,带隙是DFT计算出来的还是实验测出来的? 10+3 大力2010 2024-12-21 6/300 2024-12-22 18:08 by Ayase_lumi
[硕博家园] 脂质氧化 +3 song794 2024-12-22 4/200 2024-12-22 14:12 by song794
[考博] 中山医学院生物信息申博 +3 wcy98117 2024-12-22 3/150 2024-12-22 13:42 by k1f01@4s
[论文投稿] 投稿意见求助,没弄清回答的方向 8+4 moonlig 2024-12-18 4/200 2024-12-22 08:51 by steven_198377
[论文投稿] 投稿期刊 5+4 王丽媛西西西 2024-12-17 7/350 2024-12-22 04:44 by yudaoqian88
[考博] 华南理工大学 “新能源交叉创新团队--主动安全”课题组招收海外联合培养博士生 +4 hubble 2024-12-20 5/250 2024-12-21 16:16 by 那片叶落
[教师之家] 学校排名靠前发展好,最大的受益者是校领导还是普通老师? +6 akslis2024 2024-12-17 7/350 2024-12-21 11:22 by 凌晨一点393
[论文投稿] 投稿投错期刊,怎么撤稿? 200+4 birrd 2024-12-17 8/400 2024-12-20 14:53 by yiran909
[教师之家] 某老师在组会上总是针对我带的学生怎么办? +15 lice_1987 2024-12-17 23/1150 2024-12-20 04:50 by 胖胖的大海
[论文投稿] Molecular Crystals and Liquid Crystals投稿8个月没有信息 +4 书剑如风 2024-12-17 12/600 2024-12-20 04:40 by 胖胖的大海
[论文投稿] 毕业论文疑虑 20+6 风吹荷叶煞 2024-12-17 17/850 2024-12-18 17:35 by holypower
信息提示
请填处理意见