24小时热门版块排行榜    

查看: 4686  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

古韵清音

银虫 (小有名气)

[求助] qRT-PCR的数据处理问题,error bar应该怎么做?

我的实验是去医院收样本来做的,一次收不了几个,所以用荧光PCR做相对定量只能分很多次做,这样我要最后把数据集中起来就没有办法直接用仪器给出的图表,而且有些数据我也还要筛选一下。
现在我想自己把数据整出来之后用excel或者graphpad之类来做柱状图,但是现在不知道error bar应该怎么做,我仔细看了下仪器的分析结果,好像它的error bar用的是RQ max和RQ min,所以请问一下,这里的error bar难道不是用SD么?我的SD是用目的基因CT减去内参CT之后的值计算的,高的时候有0.23。但是用SD的话,因为柱状图的高度是2-△△CT,所以直接用SD的话会出现比如柱高是0.02但error bar有0.23左右,我觉得不大对啊,想请问下各位牛人,这个数据到底是怎么处理的?

[ Last edited by 古韵清音 on 2012-9-9 at 23:41 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
SD和SE不是一回事,SD=STDEV, 而SE=STANDARD ERROR, SD=SE/SQRT(X), X=样品数。
5楼2012-09-11 19:04:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

xw19880905

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-09-11 16:02:48
古韵清音: 金币+5, 有帮助, 后来看到一篇文献。。。现在搞清楚了 2012-09-12 16:50:25
是用SD计算,但是我觉得你操作中是不是两个概念混淆了,因为算SD时也要先算出-△△CT值,在算出2-△△CT,再才计算SD值,你试试看,是不是这不没做?
2楼2012-09-11 10:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-09-11 16:03:00
古韵清音: 金币+4, 有帮助, 但是我看到的文献是,最后的error bar还要用power(2,-a)的SD值再除以一个作为对照的样本的power(2,-a) mean 2012-09-12 16:52:46
我们处理数据的时候也是用基因CT减去内参CT,然后我们算值是用EXCEL里的公式算的--power(2,-a),然后再用三组这个值来做ERROR BAR,EXCEL可自动生成。
希望实验能顺利!
3楼2012-09-11 15:54:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得你可能就是没弄清楚用哪个做ERROR BAR吧,如果只是结果不理想,那就是你的数据偏差较大!
持之以恒、永不放弃!
4楼2012-09-11 17:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见