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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » qRT-PCR的数据处理问题，error bar应该怎么做？
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古韵清音

银虫 (小有名气)

[求助] qRT-PCR的数据处理问题，error bar应该怎么做？

我的实验是去医院收样本来做的，一次收不了几个，所以用荧光PCR做相对定量只能分很多次做，这样我要最后把数据集中起来就没有办法直接用仪器给出的图表，而且有些数据我也还要筛选一下。
现在我想自己把数据整出来之后用excel或者graphpad之类来做柱状图，但是现在不知道error bar应该怎么做，我仔细看了下仪器的分析结果，好像它的error bar用的是RQ max和RQ min，所以请问一下，这里的error bar难道不是用SD么？我的SD是用目的基因CT减去内参CT之后的值计算的，高的时候有0.23。但是用SD的话，因为柱状图的高度是2-△△CT，所以直接用SD的话会出现比如柱高是0.02但error bar有0.23左右，我觉得不大对啊，想请问下各位牛人，这个数据到底是怎么处理的？

[ Last edited by 古韵清音 on 2012-9-9 at 23:41 ]
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1楼 2012-09-09 23:37:37
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
SD和SE不是一回事，SD=STDEV, 而SE=STANDARD ERROR, SD=SE/SQRT(X), X=样品数。
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5楼2012-09-11 19:04:05
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xw19880905

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-09-11 16:02:48
古韵清音: 金币+5, ★有帮助, 后来看到一篇文献。。。现在搞清楚了 2012-09-12 16:50:25
是用SD计算，但是我觉得你操作中是不是两个概念混淆了，因为算SD时也要先算出-△△CT值，在算出2-△△CT，再才计算SD值，你试试看，是不是这不没做？
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2楼2012-09-11 10:58:53
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天虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-09-11 16:03:00
古韵清音: 金币+4, ★有帮助, 但是我看到的文献是，最后的error bar还要用power（2，-a）的SD值再除以一个作为对照的样本的power（2，-a） mean 2012-09-12 16:52:46
我们处理数据的时候也是用基因CT减去内参CT，然后我们算值是用EXCEL里的公式算的--power(2,-a)，然后再用三组这个值来做ERROR BAR，EXCEL可自动生成。
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希望实验能顺利！
3楼2012-09-11 15:54:16
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gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我觉得你可能就是没弄清楚用哪个做ERROR BAR吧，如果只是结果不理想，那就是你的数据偏差较大！
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持之以恒、永不放弃！
4楼2012-09-11 17:02:04
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