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cofe

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】有关qRT-PCR的问题 已有5人参与

paper要求用qRT-PCR来表述过量表达株系某基因的表达量,请问用相对含量还是绝对拷贝数比较好?能否推荐一篇已发表的文章给我参考参考。
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

cofe(金币+1): 2010-05-31 16:40:25
cofe(金币+1): 2010-06-05 21:22:40
一般这种情况是做相对定量,绝对定量用于检测,比如病毒、细菌感染量的检测。我是做动物的,文章就不推荐了
2楼2010-05-31 16:20:11
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peiliangshu

铜虫 (小有名气)

cofe(金币+1): 2010-05-31 16:40:34
cofe(金币+1): 2010-06-05 21:22:53
使用相对定量就可以了
但是要有标准品才行
3楼2010-05-31 16:33:36
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by peiliangshu at 2010-05-31 16:33:36:
使用相对定量就可以了
但是要有标准品才行

相对定量,不是用内参吗?标准品是怎么回事?
4楼2010-05-31 16:48:22
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cofe

金虫 (小有名气)

我想他说的标准品就是内参。
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-05-31 16:48:22:


相对定量,不是用内参吗?标准品是怎么回事?

5楼2010-05-31 16:59:29
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peiliangshu

铜虫 (小有名气)


lstt09nk(金币+1):感谢交流~~ 2010-06-04 17:27:04
标准品一般是已知浓度的质粒
可以去生物公司或中检所购买
6楼2010-06-04 17:26:03
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匿名

用户注销 (著名写手)

cofe(金币+1): 2010-06-05 21:23:05
本帖仅楼主可见
7楼2010-06-04 20:05:24
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cofe

金虫 (小有名气)

我说的是用相对定量的qRT-PCR来确认是过量表达株系的文章,这几天还真没找到这样的文章,类似的结果大多用半定量的RT-PCR来表示。可审稿人偏要我用qRT-PCR表示。
麻烦您推荐一篇。
引用回帖:
Originally posted by 彬心玉壶 at 2010-06-04 20:05:24:
相对定量,

用内参,一些本底表达的管家基因,

文章一搜一大堆。你应该会!

8楼2010-06-05 21:28:39
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ben1147

木虫 (正式写手)

cofe(金币+1):4 2010-06-06 13:26:03
引用回帖:
Originally posted by cofe at 2010-06-05 21:28:39:
我说的是用相对定量的qRT-PCR来确认是过量表达株系的文章,这几天还真没找到这样的文章,类似的结果大多用半定量的RT-PCR来表示。可审稿人偏要我用qRT-PCR表示。
麻烦您推荐一篇。

现在半定量已经不能满足很多审稿人的要求了,不但是做一般的表达分析要定量,就连过表达转基因株系的确定也要有定量数据,用来证明过表达的程度和引起效应程度之间的相关性,这样的文章确实也很多了,不应该没有看到的

比如下面这篇
Galactinol and raffinose as a novel function to protect plants from oxidative damage

http://www.plantphysiol.org/cgi/content/abstract/147/3/1251
9楼2010-06-05 22:24:07
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匿名

用户注销 (著名写手)

cofe(金币+1):1 2010-06-06 13:26:21
本帖仅楼主可见
10楼2010-06-06 02:45:45
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