24小时热门版块排行榜    

查看: 791  |  回复: 7

凤凰城边

银虫 (正式写手)

[求助] 建库 电转化

请问 建库一定要做电转化吗?我想做对一个基因的改造,利用引物上的几个随机碱基进行基因改造,建一个库 ,然后在筛选,是不是用普通转化的话库容量不够啊?要做电转化才能保证库容量?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

爱拼才会赢
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

whui

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+5, 鼓励应助 2012-09-05 14:12:55
小丹木木: 回帖置顶 2012-09-05 14:12:58
凤凰城边: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-09-06 20:30:16
事实上化转也可以达到9~10次方,但基本属于可遇不可求:)并且这只是在转化标准质粒的情况下得到,如果是连接产物,要降低1~2个数量级。
通常商品化感受态在8次方(质粒),按这个标准转化连接产物,能得到10E5~6次方库容(每个转化),如果你想得到>8次方库容,至少要做上百次转化:)
具体到你的问题,你可以大概计算下你所需的理论库容:每个随机位点最多四种可能(N=A/G/C/T;)几个随机碱基理论上总共会产生多少组合,再乘以1000(转化和筛选造成的损失),基本就是理论库容。如果库容在6次方一下,也可以化转。当然,任何时候都是建议:库容越大越好!
Good luck!
3楼2012-09-05 13:50:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

flyliuyuan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-09-05 14:12:34
是的,普通的化转转化率在6此方左右,而电转化的转化效率可以达到8次方甚至更多,对于建库,他要求库容量要足够大,所以还是要求转化率的,但是转化率还和连接物的连接比例有关,这需要摸索
2楼2012-09-05 06:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我不是稻草人

新虫 (初入文坛)

ls所言极是,一般而言化转可达10E5-10E6,再多就得祈求RP大爆发了。

采取哪种方式,取决于你需要多大的库容。如果你要10E6以上,建议你做电转,基本上一次可以搞定;小于10E6,可以用化转,用不了几次也就搞定了。

ps,建一个库也不是越大越好,得看你的需求。如果10E6足够了,那就无所谓为了追求大库容而盲目去做,毕竟大的库需要消耗的资源和精力也多。
我不是稻草人
4楼2012-09-06 16:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凤凰城边

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by whui at 2012-09-05 13:50:49
事实上化转也可以达到9~10次方,但基本属于可遇不可求:)并且这只是在转化标准质粒的情况下得到,如果是连接产物,要降低1~2个数量级。
通常商品化感受态在8次方(质粒),按这个标准转化连接产物,能得到10E5~6次 ...

谢谢啊,我的可能要七次方,找一些文献希望能够优化感受态细胞,使能够提高转化率,电转好像也麻烦啊!不过要谢谢提醒
爱拼才会赢
5楼2012-09-06 20:26:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凤凰城边

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by flyliuyuan at 2012-09-05 06:54:53
是的,普通的化转转化率在6此方左右,而电转化的转化效率可以达到8次方甚至更多,对于建库,他要求库容量要足够大,所以还是要求转化率的,但是转化率还和连接物的连接比例有关,这需要摸索

谢谢,电转化是效率高,但是连接产物要转化的话,还要处理,觉得麻烦啊。想优化感受态细胞的制备,希望能行吧
爱拼才会赢
6楼2012-09-06 20:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凤凰城边

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 我不是稻草人 at 2012-09-06 16:28:51
ls所言极是,一般而言化转可达10E5-10E6,再多就得祈求RP大爆发了。

采取哪种方式,取决于你需要多大的库容。如果你要10E6以上,建议你做电转,基本上一次可以搞定;小于10E6,可以用化转,用不了几次也就搞定了 ...

谢谢回复,电转没有做过,做的话可能要摸索一段时间,现在想先做出一个结果就是能偶证明改造时可行的,有需要的话在做电转,电转方面还有很多不知道,要学习的啊。
爱拼才会赢
7楼2012-09-06 20:29:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wushu

捐助贵宾 (初入文坛)

一个电转化基本可以达到10^7左右,化转别想了
一个人的态度决定一个人的高度
8楼2012-09-23 22:00:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 凤凰城边 的主题更新
信息提示
请填处理意见