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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于稀有密码子的优化，请求大家指教
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475502411

铜虫 (著名写手)

[求助] 关于稀有密码子的优化，请求大家指教

我的目的基因和载体连接上，是异源表达，怎么都表达不出来，就查看了常见的原因，结果发现序列存在很多的稀有密码子，现在想优化后化学合成，我没有做过这方面的，是不是直接把稀有密码子换成大肠杆菌偏爱密码子就可以刻呢？会不会影响表达出来蛋白的构象啊？要注意什么呢？表达菌株是BL21。
希望能给我提点建议
谢谢
我的序列，请大侠帮我看看
atggagagcacaacatcaggattcctaggacccctgctcgtgttacaggcggggtttttcttgttgacaagaatcctcacaataccacagagtctagactcgtggtggacttctctcaattttctagggggagcacccacgtgtcctggccaaaattcgcagtccccaacctccaatcactcaccaacctcttgtcctccaacttgtcctggctatcgctggatgtgtctgcggcgttttatcatattcctcttcatcctgctgctatgcctcatcttcttgttggttcttctggactaccaaggtatgttgcccgtttgtcctctacttccaggaacatcaactaccagcacgggaccatgcagaacctgcacgattcctgctcaaggaacctctatgtttccctcttgttgctgtacaaaaccttcggacggaaactgcacttgtattcccatcccatcatcctgggctttcgcaagattcctatgggagtgggcctcagtccgtttctcctggctcagtttactagtgccatttgttcagtggttcgtagggctttcccccactgtttggctttcagctatatggatgatgtggtattgggggccaagtctgtacaacatcttgagtccctttttacctctattaccaattttcttttgtctttgggtatacatt
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可以朝九晚五，也能浪迹天涯
1楼 2012-08-29 08:44:01
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tanglian8655

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
475502411: 金币+5 2012-08-30 11:09:28
稀有密码子过多的话，用表达菌株rosetta试一试吧，专门针对稀有密码子的
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10楼2012-08-30 09:56:30
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lintaosong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
475502411: 金币+10 2012-08-29 13:17:04
给你个网站 这里你可以自己按照表达载体进行优化http://www.kazusa.or.jp/codon/
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2楼2012-08-29 11:54:30
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475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lintaosong at 2012-08-29 11:54:30
给你个网站 这里你可以自己按照表达载体进行优化http://www.kazusa.or.jp/codon/

但是打开第一栏就是输入物种，我用的是BL21，但是我不知道应该是属于大肠杆菌的那个分类？
敬请指点！
不好意思我这个实在不懂，见谅
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可以朝九晚五，也能浪迹天涯
3楼2012-08-29 13:16:56
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475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lintaosong at 2012-08-29 11:54:30
给你个网站 这里你可以自己按照表达载体进行优化http://www.kazusa.or.jp/codon/

我用的载体是PET-28a，宿主是BL2，能不能给我写一下操作步骤呢？谢谢
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可以朝九晚五，也能浪迹天涯
4楼2012-08-29 13:18:49
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