| 查看: 2342 | 回复: 6 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[求助]
相互作用力能否用高斯计算证明
|
||||
|
实验已经证实一个酶和底物之间有着很强的结合理，现在要通过计算为其提供理论依据，如果将两部分结合的残基进行优化，得到的稳定结构，那么通过这个稳定结构能否说他们之间的相互作用呢？ ps:酶与底物之间的相互作用力有：氢键，盐桥，疏水作用，范德华力、 要说明这两部分强的相互作用，还有别的什么办法么？ 谢谢大家！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 收藏贴 | MD资料 |
» 猜你喜欢
2026年西华大学材料学院-材料近净成形与表面技术研究团队-招收调剂研究生
已经有9人回复
-
调剂信息
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有76人回复
-
国家大人才课题组招收化学、材料化工类2026年调剂生
已经有0人回复
-
浙师大化与材学院2026年有大量硕士研究生调剂名额 （线上 调剂）
已经有8人回复
-
河北农大生物与医药专业招收调剂，名额充足
已经有0人回复
-
齐鲁工业大学 国家重点实验室-新能源、锂离子电池、材料、化学方向
已经有0人回复
-
吉林工程技术师范学院 材料与化工 （0856） 招收调剂
已经有5人回复
-
杰青/长江团队招收调剂
已经有0人回复
-
中南林业科技大学罗勇锋教授团队2026年招收材料类调剂研究生
已经有0人回复
-
国家大人才课题组招收化学、材料化工类2026年调剂生
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误
已经有17人回复
- 高斯计算两个有机分子
已经有11人回复
- 用高斯做相互作用能校正
已经有10人回复
- 在进行高斯计算时如何消去虚频（转载）
已经有18人回复
- 高斯计算中zORA方法是否可以使用
已经有9人回复
- 【求助】高斯计算td的问题
已经有9人回复
- 【求助】如何用高斯计算一个分子中的某一部分HOMO和LUMO？
已经有7人回复
- 【求助】高斯计算分子结合能
已经有8人回复
- 【求助】高斯计算出错
已经有11人回复
- 【求助】高斯计算分子芳香性出错
已经有12人回复
- 【讨论】怎样用高斯计算物质的pka
已经有10人回复
飞行鸟
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 2135 (讲师)
- 金币: 22804.4
- 散金: 5054
- 红花: 377
- 沙发: 6
- 帖子: 16032
- 在线: 1486.8小时
- 虫号: 638457
- 注册: 2008-10-27
- 专业: 宇宙学
5楼2012-08-23 22:01:22
dongshui22
金虫 (初入文坛)
二逼四品带刀护卫
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2061.3
- 帖子: 30
- 在线: 116.7小时
- 虫号: 1261619
- 注册: 2011-04-11
- 性别: GG
- 专业: 结构化学
2楼2012-08-21 11:30:13
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2012-08-21 18:22:43
gmy1990: 金币+3 2012-08-21 18:22:43
|
光从结构上很难说明什么。 图形化的研究方法见我以前小木虫上发的《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》一帖，可以看出范德华、氢键、盐桥的作用区域和强度。也可以考虑用probe程序可视化相互作用，见http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php mmpbsa计算结合自由能各种成分并做能量分解也是常用研究方法，范德华、静电以及疏水作用能都可以算出来。 |
3楼2012-08-21 15:20:47
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-08-23 16:59:40
