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用高斯做相互作用能校正
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用高斯做相互作用能校正，报错信息Center name "(Fragment" is too long，输入文件完全按照手册上的内容编的，各位大神帮帮忙啊~ [ Last edited by nunup5 on 2012-3-22 at 09:58 ] |
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 高斯日常学习总结 |
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6楼2012-03-22 11:04:45
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2楼2012-03-22 10:40:25
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%mem=6GB %LindaWorker=node7-ib %chk=1-I.chk #p sp cam-b3lyp/genecp counterpoise=2 gfinput gfprint iop(6/7=3) 1-I -1,1 0,1 -1,1 Ru(Fragment=1) -0.04595169 -0.25907165 -1.26816463 N (Fragment=1) -0.97329469 0.97784635 0.08836637 C (Fragment=1) -0.39185869 2.03359635 0.72681637 C (Fragment=1) -2.31454169 0.71996735 0.30664737 想用优化完的结构直接算一下单点能，结果读到分子构型的时候就出错了~ |
3楼2012-03-22 10:44:51
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4楼2012-03-22 11:03:52
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5楼2012-03-22 11:04:20
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nunup5: 金币+7, ★★★很有帮助, 谢谢，有第二部分的原子，在复制的时候可能落下了，我回去试试别的泛函！ 2012-03-22 14:04:45
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给你发一个我算过的正确的计算作用能的输入文件。供你参考。 %chk=1.chk %nprocshared=8 %mem=10GB #p um062x/6-311+g(3df,2p) scf=(qc,tight) Counterpoise=2 Title Card Required 0,2 0,1 0,2 C(fragment=1) 0.35711600 -0.00413000 0.21825900 C(fragment=1) 0.01598800 -0.02056700 1.69102600 Cl(fragment=1) 2.10840500 -0.23501300 -0.02155400 Cl(fragment=1) -0.12041200 1.56269300 -0.50577800 Cl(fragment=1) -0.51874800 -1.31547100 -0.62890600 H(fragment=1) -1.05940300 0.11303200 1.80898800 H(fragment=1) 0.55235100 0.78626100 2.19064700 H(fragment=1) 0.31914100 -0.97819600 2.11446700 O(fragment=2) -3.02506300 -0.05397700 0.32157600 H(fragment=2) -2.82738700 0.45136900 -0.48636800 你的文件出错有以下几个原因。最主要的是你没写出碎片2包含的原子。再就是你的计算方法 cam-b3lyp/genecp ，我没用过这个。你可以将输入文件换成别的方法，试着跑一下，看还出错吗？要是正常的话，就是方法的问题咯 |
7楼2012-03-22 12:18:53
nunup5
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9楼2012-03-22 14:30:12
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nunup5: 金币+3, ★★★很有帮助, 大哥，你是正解，确实是加空格了呀~ 2012-03-22 18:42:43
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nunup5: 金币+3, ★★★很有帮助, 大哥，你是正解，确实是加空格了呀~ 2012-03-22 18:42:43
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N (Fragment=1) -0.97329469 0.97784635 0.08836637 C (Fragment=1) -0.39185869 2.03359635 0.72681637 C (Fragment=1) -2.31454169 0.71996735 0.30664737 弱弱的问一句，你的原子后面是不是空格了呢？ 如果实在不行，你把（fragment *）全部删掉，在坐标后面加1（或2）试试，例如： H -0.046866 0.1 0.586860 1 Br -0.331864 0.1 -0.801000 1 F 0.396755 0.1 2.739275 2 H 0.584835 0.1 3.641534 2 |
10楼2012-03-22 18:21:42
