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nunup5

木虫 (小有名气)

[求助] 用高斯做相互作用能校正

用高斯做相互作用能校正，报错信息Center name "(Fragment" is too long，输入文件完全按照手册上的内容编的，各位大神帮帮忙啊~

[ Last edited by nunup5 on 2012-3-22 at 09:58 ]
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1楼2012-03-22 08:37:21
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回帖置顶 ( 共有1个 )

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★
nunup5: 回帖置顶 2012-03-22 14:04:52
小红豆: 金币+2, 3X 2012-03-22 18:37:37
cam-b3lyp这个不是用来算能量的。普通的B3LYP就行
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前途光明，出路难觅！
6楼2012-03-22 11:04:45
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普通回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
你的把输入文件给大家看看吧
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前途光明，出路难觅！
2楼2012-03-22 10:40:25
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nunup5

木虫 (小有名气)
%mem=6GB
%LindaWorker=node7-ib
%chk=1-I.chk
#p sp cam-b3lyp/genecp counterpoise=2
     gfinput
     gfprint
     iop(6/7=3)

1-I

-1,1 0,1 -1,1
Ru(Fragment=1)                -0.04595169   -0.25907165   -1.26816463
N (Fragment=1)                -0.97329469    0.97784635    0.08836637
C (Fragment=1)                -0.39185869    2.03359635    0.72681637
C (Fragment=1)                -2.31454169    0.71996735    0.30664737


想用优化完的结构直接算一下单点能，结果读到分子构型的时候就出错了~
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3楼2012-03-22 10:44:51
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
没有第二片？
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前途光明，出路难觅！
4楼2012-03-22 11:03:52
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★
zhou2009: 金币+2 2012-03-22 11:12:42
gfinput     gfprint
写一个就行了
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前途光明，出路难觅！
5楼2012-03-22 11:04:20
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21018060

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nunup5: 金币+7, ★★★很有帮助, 谢谢，有第二部分的原子，在复制的时候可能落下了，我回去试试别的泛函！ 2012-03-22 14:04:45
给你发一个我算过的正确的计算作用能的输入文件。供你参考。
%chk=1.chk
%nprocshared=8
%mem=10GB
#p um062x/6-311+g(3df,2p) scf=(qc,tight) Counterpoise=2

Title Card Required

0,2 0,1 0,2
C(fragment=1)                0.35711600   -0.00413000    0.21825900
C(fragment=1)                0.01598800   -0.02056700    1.69102600
Cl(fragment=1)               2.10840500   -0.23501300   -0.02155400
Cl(fragment=1)              -0.12041200    1.56269300   -0.50577800
Cl(fragment=1)              -0.51874800   -1.31547100   -0.62890600
H(fragment=1)               -1.05940300    0.11303200    1.80898800
H(fragment=1)                0.55235100    0.78626100    2.19064700
H(fragment=1)                0.31914100   -0.97819600    2.11446700
O(fragment=2)               -3.02506300   -0.05397700    0.32157600
H(fragment=2)               -2.82738700    0.45136900   -0.48636800
你的文件出错有以下几个原因。最主要的是你没写出碎片2包含的原子。再就是你的计算方法 cam-b3lyp/genecp ，我没用过这个。你可以将输入文件换成别的方法，试着跑一下，看还出错吗？要是正常的话，就是方法的问题咯
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Tomorrow will be better
7楼2012-03-22 12:18:53
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nunup5

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lihb734 at 2012-03-22 11:03:52:
没有第二片？

第二片我没贴，在下面
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8楼2012-03-22 14:02:47
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nunup5

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lihb734 at 2012-03-22 11:04:45:
cam-b3lyp这个不是用来算能量的。普通的B3LYP就行

我换了泛函还是一样的错误啊~救命啊~
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9楼2012-03-22 14:30:12
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viger87

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nunup5: 金币+3, ★★★很有帮助, 大哥，你是正解，确实是加空格了呀~ 2012-03-22 18:42:43
N (Fragment=1)                -0.97329469    0.97784635    0.08836637
C (Fragment=1)                -0.39185869    2.03359635    0.72681637
C (Fragment=1)                -2.31454169    0.71996735    0.30664737
弱弱的问一句，你的原子后面是不是空格了呢？
如果实在不行，你把（fragment *）全部删掉，在坐标后面加1（或2）试试，例如：
H   -0.046866  0.1   0.586860   1
Br  -0.331864  0.1  -0.801000   1
F    0.396755  0.1   2.739275   2
H    0.584835  0.1   3.641534   2
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有花堪折直须折，末待花落空折枝！
10楼2012-03-22 18:21:42
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