| 查看: 2339 | 回复: 6 | ||||
[求助]
相互作用力能否用高斯计算证明
|
|
实验已经证实一个酶和底物之间有着很强的结合理，现在要通过计算为其提供理论依据，如果将两部分结合的残基进行优化，得到的稳定结构，那么通过这个稳定结构能否说他们之间的相互作用呢？ ps:酶与底物之间的相互作用力有：氢键，盐桥，疏水作用，范德华力、 要说明这两部分强的相互作用，还有别的什么办法么？ 谢谢大家！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 收藏贴 | MD资料 |
» 猜你喜欢
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有83人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
招生材料与化工、环境科学调剂研究生
已经有5人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误
已经有17人回复
- 高斯计算两个有机分子
已经有11人回复
- 用高斯做相互作用能校正
已经有10人回复
- 在进行高斯计算时如何消去虚频（转载）
已经有18人回复
- 高斯计算中zORA方法是否可以使用
已经有9人回复
- 【求助】高斯计算td的问题
已经有9人回复
- 【求助】如何用高斯计算一个分子中的某一部分HOMO和LUMO？
已经有7人回复
- 【求助】高斯计算分子结合能
已经有8人回复
- 【求助】高斯计算出错
已经有11人回复
- 【求助】高斯计算分子芳香性出错
已经有12人回复
- 【讨论】怎样用高斯计算物质的pka
已经有10人回复
dongshui22
金虫 (初入文坛)
二逼四品带刀护卫
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2061.3
- 帖子: 30
- 在线: 116.7小时
- 虫号: 1261619
- 注册: 2011-04-11
- 性别: GG
- 专业: 结构化学
2楼2012-08-21 11:30:13
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2012-08-21 18:22:43
gmy1990: 金币+3 2012-08-21 18:22:43
|
光从结构上很难说明什么。 图形化的研究方法见我以前小木虫上发的《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》一帖，可以看出范德华、氢键、盐桥的作用区域和强度。也可以考虑用probe程序可视化相互作用，见http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php mmpbsa计算结合自由能各种成分并做能量分解也是常用研究方法，范德华、静电以及疏水作用能都可以算出来。 |
3楼2012-08-21 15:20:47
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-08-23 16:59:40
飞行鸟
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 2135 (讲师)
- 金币: 22804.4
- 散金: 5054
- 红花: 377
- 沙发: 6
- 帖子: 16032
- 在线: 1486.8小时
- 虫号: 638457
- 注册: 2008-10-27
- 专业: 宇宙学
5楼2012-08-23 22:01:22
6楼2012-08-24 18:27:25
missducksong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 516.1
- 红花: 1
- 帖子: 200
- 在线: 51.4小时
- 虫号: 2724595
- 注册: 2013-10-14
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
7楼2014-04-20 22:31:26
