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huzhihong-

新虫 (小有名气)


[交流] 请教测序结果峰形图的识别问题 已有4人参与

如图所示,测序结果读出来为A可是下面有个C的小峰,不知道该位点结果可信吗?该位点到底是A还是C,遗传来看应该不是杂合体。
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wittyjc

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般认为是A 下面C峰可能是测序误差什么的。

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2楼2012-08-11 10:58:10
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lentinula

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果是pcr产物直接测序,上面的情况,可以通过克隆后再重新测序确证。也有可能是这个位点原本就是A/C,试试呗,反正花不了多少钱。

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3楼2012-08-11 13:42:58
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不知道你测序是做什么的?一般来说这样的结果需要重测的
低调稳重务实内敛---------------残
4楼2012-08-11 13:53:56
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lillian菲

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不知道你测序的是什么产物?也不知您是做什么用途的?
如果只是简单地测序,应该是A吧。有两个峰,说明测序时都检测到信号,但从您的图上可以看到,A的峰值比较高,说明A的信号更强一些,所以一般都选择A

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5楼2012-08-11 15:14:55
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huzhihong-

新虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wittyjc at 2012-08-11 10:58:10
一般认为是A 下面C峰可能是测序误差什么的。

谢谢!我也觉得是误差!
6楼2012-08-11 15:16:00
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huzhihong-

新虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by lentinula at 2012-08-11 13:42:58
如果是pcr产物直接测序,上面的情况,可以通过克隆后再重新测序确证。也有可能是这个位点原本就是A/C,试试呗,反正花不了多少钱。

是PCR产物,正准备连T测序呢
7楼2012-08-11 15:17:28
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huzhihong-

新虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by lillian菲 at 2012-08-11 15:14:55
不知道你测序的是什么产物?也不知您是做什么用途的?
如果只是简单地测序,应该是A吧。有两个峰,说明测序时都检测到信号,但从您的图上可以看到,A的峰值比较高,说明A的信号更强一些,所以一般都选择A

是PCR产物测序,是为了测突变基因,如果是A就突变了,C就是正常的,但是从遗传看不应该是杂合体。
8楼2012-08-11 16:59:10
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