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asd724210

银虫 (初入文坛)

[求助] 知道cDNA序列,如何知道它的编码区和非编码区

我从genebank上面得到一段序列,我想知道它所编码的蛋白质,
但我不会推测这个cDNA的非编码区。。
求助。。
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

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EST是expression sequence tag,所以肯定是编码区了。
7楼2012-08-03 08:23:04
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八戒八戒

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
CDNA是由原DNA序列上的编码区转录生成的RNA反转录生成的,所以CDNA都是编码区
2楼2012-08-02 09:55:46
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hongqifei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by 八戒八戒 at 2012-08-02 09:55:46
CDNA是由原DNA序列上的编码区转录生成的RNA反转录生成的,所以CDNA都是编码区

cDNA除了编码区还有5‘和3’调控区。
你从genebank上面得到一段序列,首先应该明确是基因组DNA还是cDNA,然后去看相关注释或者用生物信息学工具去预测(例如http://www.cbs.dtu.dk/services/)。
何须剑道争锋?千人指,万人封,可问江湖鼎峰,三尺秋水尘不染,天下无双。
3楼2012-08-02 14:31:29
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asd724210

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hongqifei at 2012-08-02 14:31:29
cDNA除了编码区还有5‘和3’调控区。
你从genebank上面得到一段序列,首先应该明确是基因组DNA还是cDNA,然后去看相关注释或者用生物信息学工具去预测(例如http://www.cbs.dtu.dk/services/)。...

查到的是est
4楼2012-08-02 16:26:53
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