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lren_87

铁杆木虫 (正式写手)

傻子乐

[求助] 求教:ncbi回复中identifier应该怎么理解?

前几天向genbank递交一段序列,随后收到了一封mail,大意理解了,但是一段话没能很好的理解,希望有经历的人给我指点一下:
[2] Provide a clone/isolate/strain or other unique identifier
for your record.  For a more detailed explanation, see below.
他的解释如下:
strain vs. clone:

If the sequence was obtained from a cultured isolate, then a strain
identifier is required. (A strain identifier is not the same as a
species epithet. The proper species name of your bacterial isolate is
not required.) Strain identifiers distinguish specific cultures so a
historical continuity can be traced from the parent culture to any
subsequent subculture(s).
  
This is important when strains differ at an infraspecies level, or,
in some cases, when they have been misidentified and are consequently
reclassified in another species. The strain designation you provide
will serve to distinguish yours from other extant and future isolates
that might be obtained elsewhere. Your isolates do not need to be
deposited in a culture collection in order to have strain designations.
A strain may be designated in any manner: by the name of an individual
or locality, or by a string of numbers and/or letters. For example,
how do you distinguish this culture in your laboratory notebook?

我想知道具体的含义是什么,我该怎么答复,谢谢。
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大浪淘沙
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
silicare: 金币+2, 谢谢参与 2012-07-19 09:15:11
引用回帖:
6楼: Originally posted by lren_87 at 2012-07-18 14:20:37
species epithet
指的的物种的俗名吧?...

species epithet是生物的种名 比如Escherichia coli里面的coli

株ID是每个菌株独有的ID 有ATCC NCTC等
估计他只需要你提供其中之一就可以了
也可能是某个菌株特有的 约定俗成的名字
7楼2012-07-18 14:31:59
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-18 08:41:59
strain identifier就是strain ID (不是物种名)
他下面详细介绍了什么是strain identifier 和使用它的必要性

如果你忘记告诉他 那么回复他正确的strain ID就可以了
2楼2012-07-18 08:37:49
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lren_87

铁杆木虫 (正式写手)

傻子乐

引用回帖:
2楼: Originally posted by Davidzjy at 2012-07-18 08:37:49
strain identifier就是strain ID (不是物种名)
他下面详细介绍了什么是strain identifier 和使用它的必要性

如果你忘记告诉他 那么回复他正确的strain ID就可以了

是不是就是描述清楚界门纲目科属种就行?
大浪淘沙
3楼2012-07-18 13:51:00
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lren_87 at 2012-07-18 13:51:00
是不是就是描述清楚界门纲目科属种就行?...

不是的
他在括号里面特意强调了不是种类名species epithet
而是株名 包括培养环境等性质的那个
4楼2012-07-18 13:53:35
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