| 查看: 2097 | 回复: 4 | ||
[求助]
Openbabel求教
|
不知道谁用过Openbabel吗？我用的是OpenbabelGUI，里边提供了4种指纹，MACCS、FP2、FP3、FP4。我想知道有没有提供指纹对照表，也就是我怎样确定生成的指纹的含义。求赐教。希望有这方面经验的能给我指点一下。非常感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员
已经有10人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有228人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已经有2人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
-
求ENDNOTE破解软件安装包
已经有4人回复
-
河海大学 （211.双一流高校）钙钛矿光电实验室丁勇团队欢迎有志青年！
已经有3人回复
-
黑龙江省原子能研究院化学课题组招收2026级化学专业或化学相关专业硕士生
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 新手求教一个液相问题
已经有4人回复
- 如何用open babel软件把PDB格式的文件转换成mol2格式？
已经有8人回复
- Taylor & Francis 的 open access 邮件要回复吗？
已经有7人回复
- 求教哪个学校的实验室或者老师与蒙牛或者伊利有合作或者交流啊~想取点生乳样品
已经有9人回复
- 求教：20%的淀粉浆如何配制啊？
已经有16人回复
- 求教怎么将0-16.7mv之间的电压信号放大
已经有4人回复
- 求教如何将chemdraw 画的cdf平面文件转化为GOLD能识别的三维MOL2文件
已经有3人回复
- QSPR中Edragon的输出数据问题
已经有7人回复
- DFT Scan之后使用MP2计算能量，如何建立批量输入文件？
已经有6人回复
- 求教酸碱中和滴定中是否能用百里香酚酞代替酚酞？
已经有5人回复
- 分子对接中mol文件用open babel 转化为mol2
已经有11人回复
- 关于open access期刊求教！
已经有13人回复
- 【求助】求教NH2OH
已经有4人回复
- 【求助】求教~
已经有18人回复
- 【求助】相似度的算法
已经有7人回复
- 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
已经有42人回复
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
yljsea2楼2012-07-05 11:35:26
3楼2012-07-05 16:02:07
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
【答案】应助回帖
|
从指纹反推出子结构，对于简单类型的指纹定义来说是可以的；但如您所说，现在大部分指纹都是“多层次”的，因此，应该说，反推是一个Impossible Mission（就像假设阿汤不再离婚）。 多层（或者叫多级）指纹的定义比较复杂，俺不建议您追究这个事情； 分子指纹设计的目的，只是比较分子结构的相似性，以及观察大量分子结构的分类（聚类）情况，并不是要反推结构（因为您是先有结构、再算指纹）。 原则上，任何不以结婚为目的的恋爱基本上都属于耍流氓，因此，任何不以比较分子相似性而试图反推结构的尝试，都属于...... 不知您的导师是哪位，怎么往这个沟里带您？或者说，有啥创新性的想法，不想让俺知道？ 不开玩笑了。Sybyl，Discovery Studio和MOE这类大型药物设计软件，因为是商业化的，所以说明书都比较规范，您可以查阅它们关于分子指纹的解释。OpenBabel因为是开放软件，文档就不那么严格了。 |
4楼2012-07-06 00:58:49
5楼2017-09-22 09:19:25
