| 查看: 2090 | 回复: 4 | ||
[求助]
Openbabel求教
|
不知道谁用过Openbabel吗？我用的是OpenbabelGUI，里边提供了4种指纹，MACCS、FP2、FP3、FP4。我想知道有没有提供指纹对照表，也就是我怎样确定生成的指纹的含义。求赐教。希望有这方面经验的能给我指点一下。非常感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
ELISA试验中不容忽视的细节盘点(二)
已经有0人回复
-
求助火焰封管的时候管子炸了
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有57人回复
-
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）
已经有0人回复
-
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？
已经有51人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 新手求教一个液相问题
已经有4人回复
- 如何用open babel软件把PDB格式的文件转换成mol2格式？
已经有8人回复
- Taylor & Francis 的 open access 邮件要回复吗？
已经有7人回复
- 求教哪个学校的实验室或者老师与蒙牛或者伊利有合作或者交流啊~想取点生乳样品
已经有9人回复
- 求教：20%的淀粉浆如何配制啊？
已经有16人回复
- 求教怎么将0-16.7mv之间的电压信号放大
已经有4人回复
- 求教如何将chemdraw 画的cdf平面文件转化为GOLD能识别的三维MOL2文件
已经有3人回复
- QSPR中Edragon的输出数据问题
已经有7人回复
- DFT Scan之后使用MP2计算能量，如何建立批量输入文件？
已经有6人回复
- 求教酸碱中和滴定中是否能用百里香酚酞代替酚酞？
已经有5人回复
- 分子对接中mol文件用open babel 转化为mol2
已经有11人回复
- 关于open access期刊求教！
已经有13人回复
- 【求助】求教NH2OH
已经有4人回复
- 【求助】求教~
已经有18人回复
- 【求助】相似度的算法
已经有7人回复
- 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
已经有42人回复
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
yljsea2楼2012-07-05 11:35:26
3楼2012-07-05 16:02:07
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
【答案】应助回帖
|
从指纹反推出子结构，对于简单类型的指纹定义来说是可以的；但如您所说，现在大部分指纹都是“多层次”的，因此，应该说，反推是一个Impossible Mission（就像假设阿汤不再离婚）。 多层（或者叫多级）指纹的定义比较复杂，俺不建议您追究这个事情； 分子指纹设计的目的，只是比较分子结构的相似性，以及观察大量分子结构的分类（聚类）情况，并不是要反推结构（因为您是先有结构、再算指纹）。 原则上，任何不以结婚为目的的恋爱基本上都属于耍流氓，因此，任何不以比较分子相似性而试图反推结构的尝试，都属于...... 不知您的导师是哪位，怎么往这个沟里带您？或者说，有啥创新性的想法，不想让俺知道？ 不开玩笑了。Sybyl，Discovery Studio和MOE这类大型药物设计软件，因为是商业化的，所以说明书都比较规范，您可以查阅它们关于分子指纹的解释。OpenBabel因为是开放软件，文档就不那么严格了。 |
4楼2012-07-06 00:58:49
5楼2017-09-22 09:19:25
