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西交-flx

新虫 (初入文坛)

[求助] 连接产物双酶切

请教各位大侠:
      近期做基因和真核表达载体连接实验已有个把个月,由于真核表达载体用的是pEGFP-N1,大小有4.7bp,插入的载体有2.4bp,分子量过大,导致很难连接上,重复做了四五周期连接实验;最近一次的连接产物跑胶出来三条带,貌似连接上了,之后把连接产物双酶切,跑胶显示两条带,且分子量一个为载体分子量,另一个为插入片段分子量,初步验证连接上,故送菌液去测序,但是测序结果出来只有载体的信息无任何插入基因的信息,显示好像没连接上,近期实验做的焦头烂额的,想请教大家原因,小女不胜感激~~~
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  • 附件 1 : 双酶切跑胶.bmp
  • 2012-07-17 10:58:35, 433.05 K

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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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小丹木木: 金币+3, 鼓励积极解答问题 2012-07-18 13:49:29
你拿连接产物去双酶切,不管连上与否结果不都应该是两个条带,一个载体,一个目标片段吧。所以个人认为你的验证方式就不严谨,仅仅凭这一点就拿去送测序,结果五花八门很正常。前面的实验不设计好,后面出问题了分析都不知问题出在哪。
我直白的说,做实验不要总存有侥幸心理,每一步都要验证好。不要等到后面出问题了,又分析不出来问题在哪里,又重头开始。不过这些都是我个人的实验习惯。仅仅和你交流一下。
另外建议你做连接载体量一定要少再少。不要总觉得不够。我在实验中一般浓度300ng/uL的载体我就切3uL,酶切后回收32uL洗脱体积,连接时就用1uL。仅供参考。
9楼2012-07-18 08:35:58
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 西交-flx at 2012-07-18 09:13:26
l连接产物做双酶切有两种结果呀,如果片段和载体连接上了就会酶切出各自分子量的条带,如果没有连接上,但是又长斑了,而且也提出了质粒,就说明载体自连了,酶切时不会出现两个条带,只会出现载体分子量的条带。
...

原来如此,还是做转化了是吧。你上面说的是直接用连接产物双酶切,所以误解了,抱歉。
11楼2012-07-18 11:04:42
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