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小果冻524

新虫 (小有名气)

[求助] 关于PCR的太多问题想咨询下

小妹做V6-V8区的PCR,从引物到酶都换了,现在用天根mix的热启动酶,引物是上海生工合成的986F和1401R,做降落PCR,要以第一次PCR产物为模板再做一次同样的TDPCR终于有了产物,但是二聚体太多太多,条带也很暗有时做不出的,退火温度68-58,58如图1;
        后来老师说换个试剂盒试试看,安必胜寄来个试用装,用PowerSoil提取的,也是要做两次PCR才有,而且第一次的产物什么条带都没有,以第一次产物为模板做第二次就出现图2这样,退火温度不同图有这样差异,最后选择58-48,48,会有在500bp附近的条带;
        然后现在用UltraClean提取,直接用48度的,也是做两次PCR,第一次无条带,以第一次产物为模板做第二次就出现了今天这样图3,像marker一样的产物,我都快疯掉了!!不知道为什么会这样,以前都是有或者没有这么简单,现在出来那么多非特异不知道怎么搞,恳请大家再指点指点我!!

图3,UltraClean® soil DNA Isolation Kit 试剂盒提取后做PCR结果



图2,PowerSoil® DNA Isolation Kit 试剂盒提取,不同退火温度同模板,最右边48度



图1,申能博彩的环境样品提取试剂盒,退火58度,二聚体特多
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