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staumter

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么从clustal的序列对比结果中得到我要的信息呢？

rt
我是菜鸟，没有多少金币，大家帮忙。
我在做一个肽家族（简称B）序列的对比分析，希望找到规律然后以此作为依据进行新的肽的设计或改造。
大概160多种肽链，包含两个亚家族，分别是B1和B2，B1短些大概23-25肽，B2长些大概32-34肽。
用clustalx2做了alignment分析，得出的结果看似有一定规律，比如都在C'端有一个二硫键形成的庚肽环，N‘端是有一定规律的非极性氨基酸长尾。但是不知道如何更准确的描述、利用这些信息，总感觉自己弄得有点粗糙。
想请教大家一般利用这类结果都是如何一步步分析的呢？有没有入手的点，来描述他们的规律呢？
菜鸟，问的问题可能比较乱啊，请大家多帮助。
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1楼 2012-07-12 08:32:54
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