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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

[交流] 有人做蛋白组学的吗?求交流合作 已有2人参与

如题。
我主要开发关于基于LCMS的蛋白组学软件的。
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dshlove

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
开发软件,是什么意思?你是做蛋白组学的,还是开发软件的。
2楼2012-07-05 08:44:29
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

开发 关于蛋白组学的软件,呵呵。生物信息的一个分支
3楼2012-07-05 08:55:30
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guxinhan123

银虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
能做无数据库质谱数据解析不?
4楼2012-07-06 10:53:29
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by guxinhan123 at 2012-07-06 10:53:29
能做无数据库质谱数据解析不?

de novo sequencing? MS2 data?
5楼2012-07-06 14:35:27
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guxinhan123

银虫 (正式写手)

de novo
6楼2012-07-06 15:17:26
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
6楼: Originally posted by guxinhan123 at 2012-07-06 15:17:26
de novo

Sorry the computer at work does not have a chinese input.
Our group is focusing the quantitation proteomics, which is the current trend. http://www.bioinfor.com/peaks/fe ... mp;utm_campaign=prp
PEAKS seems to be the most popular software which have the best accuracy.
Two papers related de novo sequencing:
Pevtsov, S. et al (2006) J Proteome Res, 5(11): p. 3018-28
Chen, T. et al (2001) J Comput Biol, 8(3): p.325-37
7楼2012-07-06 19:22:18
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