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scorpioneuro

木虫 (著名写手)

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[交流] 请教下如何做response更合适？（蛋白组学实验，iTRAQ相关）

一篇基于iTRAQ定量分析的蛋白组学文章，审稿者有一条意见想请教下各位虫友。

The authors should do a reciprocal labelling of control and disease samples using the 114 and 116 reagents. This could account for any false positives due to preferential labelling.

审稿者认为在采用iTRAQ进行样品标记时，需要做“反向标记”，从而在一定程度上避免（或解释说明）因为样品标记可能导致的假阳性。

---

从蛋白组学实验方法学的角度看，审稿者的看法是没有任何问题。
但当时实验室，由于一些原因没有做这个过程，而现在也不可能按照reviewer的意见进行实验重复。

想请教下如何做response 更合适

初步的response考虑是：

承认这是实验设计中的一个小失误。
但也表明我们的观点，我们实验中采取的方法也是可以接受的。

我们是将蛋白组学实验作为一个初步的筛选手段，而进一步采用其他的技术手段如WB等对蛋白组学实验的结果进行验证分析，以最终保证实验数据的可靠性，减少假阳性。没有做“反向标记”，可能会增加验证失败的风险。

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