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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 学术交流区 » 论文投稿 » 投稿求助 » 请教下如何做response更合适？（蛋白组学实验，iTRAQ相关）
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scorpioneuro

木虫 (著名写手)

[交流] 请教下如何做response更合适？（蛋白组学实验，iTRAQ相关）

一篇基于iTRAQ定量分析的蛋白组学文章，审稿者有一条意见 想请教下各位虫友。

The authors should do a reciprocal labelling of control and disease samples using the 114 and 116 reagents. This could account for any false positives due to preferential labelling.

审稿者认为在采用iTRAQ进行样品标记时，需要做“反向标记”，从而在一定程度上避免（或解释说明）因为样品标记可能导致的假阳性。

---

从蛋白组学实验方法学的角度看，审稿者的看法是没有任何问题。
但当时实验室，由于一些原因没有做这个过程，而现在也不可能按照reviewer的意见进行实验重复。

想请教下如何做response 更合适




初步的response考虑是：

承认这是实验设计中的一个小失误。
但也表明我们的观点，我们实验中采取的方法也是可以接受的。

我们是将蛋白组学实验作为一个初步的筛选手段，而进一步采用其他的技术手段如WB等对蛋白组学实验的结果进行验证分析，以最终保证实验数据的可靠性，减少假阳性。没有做“反向标记”，可能会增加验证失败的风险。
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1楼2012-01-31 16:25:14
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wellyy2005

至尊木虫 (文坛精英)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
scorpioneuro(金币+3): THX! 2012-01-31 21:58:42
可以的，增加相关没有做他提那种方法也同样发表的文章作参考。
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2楼2012-01-31 21:44:37
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bioduan

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主的答复完全可以，不仅态度端正，而且有理有据。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-02-01 11:26:09
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
good luck for you! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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5楼2012-02-01 13:47:56
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yingying15883楼
2012-01-31 21:56   回复  
祝福祝福
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