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scorpioneuro

木虫 (著名写手)


[交流] 请教下如何做response更合适?(蛋白组学实验,iTRAQ相关)

一篇基于iTRAQ定量分析的蛋白组学文章,审稿者有一条意见 想请教下各位虫友。

The authors should do a reciprocal labelling of control and disease samples using the 114 and 116 reagents. This could account for any false positives due to preferential labelling.

审稿者认为在采用iTRAQ进行样品标记时,需要做“反向标记”,从而在一定程度上避免(或解释说明)因为样品标记可能导致的假阳性。

---

从蛋白组学实验方法学的角度看,审稿者的看法是没有任何问题。
但当时实验室,由于一些原因没有做这个过程,而现在也不可能按照reviewer的意见进行实验重复。

想请教下如何做response 更合适




初步的response考虑是

承认这是实验设计中的一个小失误。
但也表明我们的观点,我们实验中采取的方法也是可以接受的。

我们是将蛋白组学实验作为一个初步的筛选手段,而进一步采用其他的技术手段如WB等对蛋白组学实验的结果进行验证分析,以最终保证实验数据的可靠性,减少假阳性。没有做“反向标记”,可能会增加验证失败的风险。
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bioduan

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
楼主的答复完全可以,不仅态度端正,而且有理有据。
4楼2012-02-01 11:26:09
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
scorpioneuro(金币+3): THX! 2012-01-31 21:58:42
可以的,增加相关没有做他提那种方法也同样发表的文章作参考。
2楼2012-01-31 21:44:37
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userhung

禁虫 (文学泰斗)


good luck for you! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
5楼2012-02-01 13:47:56
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