应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于密码子偏好性问题、密码子优化问题~~
51/1返回列表
查看: 2850  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MicEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于密码子偏好性问题、密码子优化问题~~ 已有1人参与

原因：本人的核苷酸序列没有合成的时候没有优化密码子，大小是800Kb，开头已经优化一部分，中间的主要部分没有优化。
求解答：1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
              2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章）。
              3.如果不在优化密码子会有多大的差距性，表达量会影响多少。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

基因工程和分子生物学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
小白
1楼 2012-06-19 10:13:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2012-06-19 13:46:25
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章） ...

我需要用的是拟南芥偏好的，但是这个用的是大肠杆菌偏好的。
第二种说法，是前40个么，是碱基还是氨基酸。
赞一下 回复此楼
小白
3楼2012-06-19 14:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

l68266152

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+3, MicEPI+1, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-06-19 19:48:26
nongdaylf: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-06-20 10:42:11
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章）。
有这说法，这是经验值。如果前几个密码子使用率很低的话会不表达。
3.如果不在优化密码子会有多大的差距性，表达量会影响多少。
每段序列不一样的。

不知道你用什么系统表达，我们选用了密码子优化的大肠杆菌表达系统，表达效果更好。
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己
2楼2012-06-19 13:46:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2012-06-19 13:46:25
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章） ...

我需要用的是拟南芥偏好的，但是这个用的是大肠杆菌偏好的。
第二种说法，是前40个么，是碱基还是氨基酸。
赞一下 回复此楼
小白
4楼2012-06-19 14:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

不进行密码子优化的话，表达量会有影响，同时也要考虑RNA的结构，虽然我不知道怎么优化RNA结构的。。。
赞一下 回复此楼
todayisdifficult，tomorrowismoredifficult，butthedayaftertomorrowisbeautiful
5楼2015-07-15 13:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 5/250 2026-08-23 12:09 by LR9qGULyN2ew
[基金申请] 什么时候开奖？ +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭