应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于密码子偏好性问题、密码子优化问题~~
61/1返回列表
查看: 2848  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MicEPI ，点击这里进行查看

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于密码子偏好性问题、密码子优化问题~~ 已有1人参与

原因：本人的核苷酸序列没有合成的时候没有优化密码子，大小是800Kb，开头已经优化一部分，中间的主要部分没有优化。
求解答：1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
              2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章）。
              3.如果不在优化密码子会有多大的差距性，表达量会影响多少。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

基因工程和分子生物学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
小白
1楼 2012-06-19 10:13:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

l68266152

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+3, MicEPI+1, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-06-19 19:48:26
nongdaylf: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-06-20 10:42:11
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章）。
有这说法，这是经验值。如果前几个密码子使用率很低的话会不表达。
3.如果不在优化密码子会有多大的差距性，表达量会影响多少。
每段序列不一样的。

不知道你用什么系统表达，我们选用了密码子优化的大肠杆菌表达系统，表达效果更好。
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己
2楼2012-06-19 13:46:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2012-06-19 13:46:25
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章） ...

我需要用的是拟南芥偏好的，但是这个用的是大肠杆菌偏好的。
第二种说法，是前40个么，是碱基还是氨基酸。
赞一下 回复此楼
小白
3楼2012-06-19 14:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nongdaylf

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2012-06-19 13:46:25
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章） ...

我需要用的是拟南芥偏好的，但是这个用的是大肠杆菌偏好的。
第二种说法，是前40个么，是碱基还是氨基酸。
赞一下 回复此楼
小白
4楼2012-06-19 14:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

不进行密码子优化的话，表达量会有影响，同时也要考虑RNA的结构，虽然我不知道怎么优化RNA结构的。。。
赞一下 回复此楼
todayisdifficult，tomorrowismoredifficult，butthedayaftertomorrowisbeautiful
5楼2015-07-15 13:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小星星大能量

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2012-06-19 13:46:25
1.除了重新合成，还有没有其他的办法；
点突变需要优化的位点
2.听说氨基酸序列只要优化前40个就可以提高一定的表达量，是否有这么一说，如果不是40个是多少，大约能够提高多少表达量。（希望能有相关网站和文章） ...

你好，突变前几个氨基酸密码子能提高表达的文献你能给我一些线索吗？我想讨教一下。
赞一下 回复此楼
物而不物，故能物物。
6楼2016-03-15 16:41:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nongdaylf 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 07:41 by OEbVnUOu01ol
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭