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请问如何进行蛋白突变体不同温度下稳定性的分子模拟
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| 小虫最近在做定点突变提高酶的热稳定性实验。我先通过蛋白序列比对找了两个突变位点，进行了突变，发现突变后蛋白半衰期（热稳定性）提高了2倍，结果还行。所以想整理一下资料看看能不能发个文章。但是，我发现，国外好多文章都是先用DS等软件进行分析，找到不稳定区域，然后再找突变位点，并且进行MD模拟，计算不同温度下的突变体及原来蛋白RMSD，甚至还计算单个残基的RMSD。这样写好像档次提升了很多。我也想做点这方面的东西，但是不知从何入手。用什么软件，怎样操作？请问哪位站友能给小弟指点一下。 |
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2楼2012-06-14 09:41:27
xuxm03
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3楼2012-06-16 00:20:24