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汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2019  |  回复: 7

egogg

木虫 (小有名气)

[交流] neb 收敛精度 已有2人参与

一个250个原子左右的系统,CI-NEB的收敛精度-0.5或-0.1合适不合适?-0.05实在是无法收敛。
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egogg

木虫 (小有名气)


御剑江湖: 金币+1, 谢谢回帖 2012-06-15 09:01:32
我也知道收敛精度越高越好,但是是不是当系统过大的时候,可以牺牲点精度。
2楼2012-06-11 14:52:07
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lgxyz

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖 2012-06-15 09:01:09
可以比较一下不同收敛标准的相对能量差别,0.02eV左右的话可以取低精度的收敛标准,如果计算低精度的收敛标准给出的能量差别比较大,你在写文章时也可以指出来,毕竟体系比较大,可以理解的,只要化学或物理图像清晰合理,不必过于纠结数值。
3楼2012-06-11 14:56:48
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lgxyz at 2012-06-11 14:56:48
可以比较一下不同收敛标准的相对能量差别,0.02eV左右的话可以取低精度的收敛标准,如果计算低精度的收敛标准给出的能量差别比较大,你在写文章时也可以指出来,毕竟体系比较大,可以理解的,只要化学或物理图像清晰 ...

谢谢回复!
“不同收敛标准的相对能量差别”:我大致看看初始与终止结构优化时的能量差别可不可以?
“0.02eV”: 是指整个系统的能量,还是指平均每个原子的能量?
4楼2012-06-11 15:20:12
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huangguiyang

新虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
御剑江湖: 金币+1, 谢谢回帖 2012-06-15 09:01:18
结果可能太不可靠了。

势垒值可以改变很大的。

缩小系统,造成的误差应该会更小
5楼2012-06-15 00:05:06
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by huangguiyang at 2012-06-15 00:05:06
结果可能太不可靠了。

势垒值可以改变很大的。

缩小系统,造成的误差应该会更小

不是太明白,是不是说两端的收敛精度必须和neb的一致才能够获得相对准确的势垒。
而如果收敛精度不一致,势垒的改变会很大?请问是什么原因呢?如果系统不能缩小的话,有没有更好的办法获取相对准确的结果?
6楼2012-06-15 14:21:16
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huangguiyang

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xueht987: 金币+3, 谢谢回帖,鼓励交流! 2012-06-16 00:16:47
引用回帖:
6楼: Originally posted by egogg at 2012-06-15 14:21:16
不是太明白,是不是说两端的收敛精度必须和neb的一致才能够获得相对准确的势垒。
而如果收敛精度不一致,势垒的改变会很大?请问是什么原因呢?如果系统不能缩小的话,有没有更好的办法获取相对准确的结果?...

首先要通过可视化,确认路径没错。

难以收敛是有原因的。可能是中间有其他极小值点。解决办法是找出它们,然后分段计算。

使用默认的优化方法,会比较稳定。

镜像的数目也是一个重要因素。

中间的镜像的精度要比较高才行。因为虽然有时会不怎么改变,但是有时会改变巨大。

实在不收敛。可以在顶点附近插入多个镜像。不弛豫算一下。然后根据实际鞍点比任一路径的最高能量点都低(或相等),可以得到势垒的上界值。

计算资源实在不足,缩小系统是较好的办法。
7楼2012-06-15 22:06:58
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by huangguiyang at 2012-06-15 22:06:58
首先要通过可视化,确认路径没错。

难以收敛是有原因的。可能是中间有其他极小值点。解决办法是找出它们,然后分段计算。

使用默认的优化方法,会比较稳定。

镜像的数目也是一个重要因素。

中间的镜像的 ...

谢谢回复,我用的是逐步逼近法。其实本质上也是增加镜像个数。

现在我的问题是,目前系统收敛不到我需要的精度数值。但是从收敛趋势来看,系统已经很平稳了(RM都0.001了),整个过程的可视化也比较合理,计算得到的势垒也跟实验上的数值差不多。但是就是力的精度达不到要求。

所以我想是不是可以把精度设置粗糙点让计算能够收敛了。
8楼2012-06-16 12:21:35
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