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lindsay627

银虫 (职业作家)

[求助] 有没有专门的软件可以识别基因的3‘UTR?

如题,希望各位大侠能帮个忙
如果没有软件,相应的网站亦可

如:输入一个基因的序列,软件能识别3’UTR别能够指示或者输出
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lindsay627

银虫 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by suifeng91 at 2012-06-08 13:30:03
我在UCSC做过已知基因序列的分析,http://genome.ucsc.edu/
最后显示基因组序列窗口中,选项有5’UTR EXTRONS,CDS EXTRONS,3’UTR EXTRONS,INTRONS。你可以通过点击不同选项,把目标序列区分出来。
如果你是未 ...

你给的网页居然没有我要的Aedes序列,
还有软件可以实现把基因录入,可以导出3‘UTR的么?
已经基因的序列和注册号了
3楼2012-06-08 22:28:22
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suifeng91

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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silicare: 金币+8, BioEPI+1, 应助指数+1, 鼓励新虫发帖交流 2012-06-08 13:36:32
lindsay627: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2012-06-08 22:23:52
我在UCSC做过已知基因序列的分析,http://genome.ucsc.edu/
最后显示基因组序列窗口中,选项有5’UTR EXTRONS,CDS EXTRONS,3’UTR EXTRONS,INTRONS。你可以通过点击不同选项,把目标序列区分出来。
如果你是未知基因序列,可以先做BLASTN,看是否有同源基因,再重复以上程序。
其实,相关的生物信息学网站(eg, NCBI)很多,类似功能都能实现。
人生不是一场物质的盛宴,而是一次灵魂的修炼,使它在谢幕之时比开幕之初更为高尚。
2楼2012-06-08 13:30:03
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