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xiayongxiu

金虫 (正式写手)

[求助] 相对定量荧光PCR结果分析中的SD如何计算?

本人最近做了荧光定量PCR,是相对定量。由于内参和目的基因的扩增效率不一致,所以没有用2-delta delta CT法,是用PFLAFF的 Ritio=E delta CT(cali-test)target/E delta CT(cali-test)ref。但是不知道SD是怎么算的。我的每个基因每次跑3个重复,然后做了2个生物学重复(提取2次RNA反转录做的)。请高手赐教。
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一切都要靠自己努力
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xiayongxiu

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
西瓜: 回帖置顶 2012-06-04 18:53:50
引用回帖:
3楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-06-02 00:06:37
嗯.....................
       我觉的是和deltaCT法相似的吧 分别计算表达量后再SD
       个人看法 若有说错请高手指点

2-delt delt CT法的SD算法很麻烦,用三个重复的CT值的SD开方加密之类的。就不太清楚用Pfaffll算法该怎样。不过还是谢谢你。
一切都要靠自己努力
4楼2012-06-02 15:00:45
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xiayongxiu

金虫 (正式写手)

怎么没有人回啊?我自己顶一个。恳请高手相助,本人正等着数据分析呢。我将不胜感激你的帮助。
一切都要靠自己努力
2楼2012-06-01 20:19:07
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
嗯.....................
       我觉的是和deltaCT法相似的吧 分别计算表达量后再SD
       个人看法 若有说错请高手指点

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Let God do with it as He wills
3楼2012-06-02 00:06:37
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chord

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对照组的SD:  用每个对照组和对照组平均值分别求 DELTA CT,再求对照组SD

实验组的SD:同理,但是是用对照组的FOLD CHANGE的平均值加入计算
5楼2012-06-03 17:30:59
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