| 查看: 7135 | 回复: 7 | |||
[求助]
相对定量荧光PCR结果分析中的SD如何计算？
|
| 本人最近做了荧光定量PCR，是相对定量。由于内参和目的基因的扩增效率不一致，所以没有用2-delta delta CT法，是用PFLAFF的 Ritio=E delta CT(cali-test)target/E delta CT(cali-test)ref。但是不知道SD是怎么算的。我的每个基因每次跑3个重复，然后做了2个生物学重复（提取2次RNA反转录做的）。请高手赐教。 |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有220人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 定量PCR读取荧光值的步骤需要保持多长时间？
已经有12人回复
- 荧光定量PCR。。。求助求助
已经有17人回复
- 荧光定量PCR
已经有12人回复
- 荧光定量PCR与普通PCR产物不一样？
已经有6人回复
- 荧光定量PCR(相对定量)的分析结果2-△△Ct怎么看呀?
已经有31人回复
- 【求助/交流】荧光定量PCR的结果（CT值）怎么分析？
已经有14人回复
- 【求助/交流】荧光定量pcr求助
已经有11人回复
- 【分享】荧光定量PCR简介
已经有13人回复
- 【分享】荧光定量PCR实验指南（二）
已经有12人回复
- 【分享】荧光定量PCR实验指南（一）
已经有20人回复
- 【求助/交流】荧光定量pcr
已经有11人回复
2楼2012-06-01 20:19:07
atlanticwi
金虫 (正式写手)
琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气
- MolEPI: 25
- 应助: 138 (高中生)
- 金币: 141.2
- 散金: 350
- 红花: 13
- 帖子: 536
- 在线: 313.2小时
- 虫号: 1099992
- 注册: 2010-09-15
- 专业: 植物生理与生化
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
嗯..................... 我觉的是和deltaCT法相似的吧 分别计算表达量后再SD 个人看法 若有说错请高手指点  |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
xiayongxiu3楼2012-06-02 00:06:37
4楼2012-06-02 15:00:45
5楼2012-06-03 17:30:59
6楼2012-06-03 19:18:08
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-06-04 18:54:26
xiayongxiu: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-06-06 08:18:52
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-06-04 18:54:26
xiayongxiu: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-06-06 08:18:52
| 请见 Willems, E., L. Leyns, and J. Vandesompele. 2008. Standardization of real-time PCR gene expression data from independent biological replicates. Analytical biochemistry 379(1):127-129. |
7楼2012-06-03 19:38:47
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-04 18:54:43
xiayongxiu: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-06-06 08:19:01
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-04 18:54:43
xiayongxiu: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-06-06 08:19:01
|
首先，一个实验组和一个对照组做一个基因的相对定量，然后有3个重复。 一个实验组和一个对照组会产生4个CT，其中2个内参和2个目的基因的。三个重复后就有12个CT值。 在计算实验组的倍数变化时，其中用的是对照组的ct的平均值，也就是三个重复的delta ct 的平均值，而 实验组的ct值是每一组的原始数值，3组就能求出实验组 的 SD 在计算对照组的sd 时同理，将对照组的3个实际值分别和对照组的平均值带入公式，得到3个倍数变化值（一般都接近于1） 然后求SD OK?  |
8楼2012-06-04 14:07:52
投票:
30