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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS建盒子，放入溶质，如何再空隙处添加水分子？
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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] MS建盒子，放入溶质，如何再空隙处添加水分子？

请问用MS建了box，把溶质分子加进去了，这时候怎么在空余的地方添加水分子？因为我需要自己指定溶质分子在box中的明确位置，不能让它自己随意的安置。请高手给予详细的说明，不胜感激！
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奋斗中的小木虫
1楼 2012-05-31 23:24:58
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by andong1988 at 2012-06-01 08:44:55
你要加明确的位置可以使用坐标啊。把原子一个个加进去。

这位童鞋，我说的明确的坐标是我的溶质分子，他们之间的空间顺序是我自己定义的。我的问题是如何在这些溶质分子的空隙处添加水分子，强调的是随机放置。
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奋斗中的小木虫
3楼2012-06-01 09:44:07
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by andong1988 at 2012-06-05 12:39:49
这样啊，那你可以用一下MS里的sorption模块，然后用fixed loading模块试试吧。...

请问可以详细说说吗？
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奋斗中的小木虫
6楼2012-06-07 18:27:22
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