24小时热门版块排行榜    

查看: 1405  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liudiwen

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-20 22:47:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by liudiwen at 2012-05-20 19:35:09:
还是不会啊。

给你发个示例:

package require psfgen   
topology top_all27_prot_lipid.rtf
  
segment L1 {pdb spc.pdb}   
coordpdb spc.pdb L1   
guesscoord   
writepdb spc0.pdb   
writepsf spc0.psf
   
这个tcl脚本是制作sp-c蛋白分子的PSF文件,需要的输入文件时拓扑(top_all27_prot_lipid.rtf)和 spc.pdb
在vmd里可以直接运行
4楼2012-05-20 20:38:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-20 19:28:12
参考NAMD手册 第4章 Creating PSF Structure Files
然后再上NAMD官方网站,查看里面的教程,里面很多例子都有制作PSF文件的过程
2楼2012-05-20 18:52:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liudiwen

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2012-05-20 22:19:38
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-20 22:48:52
liudiwen: 金币+5 2012-05-21 09:48:25
恕我冒犯:VMD点鼠标能完成的一切操作,都可以用脚本来完成。
随着你学习的深入,你会喜欢上用脚本。

建议你学习的时候,求教方法,而不要希望别人直接帮你把 你想要的结果给你,不然下次你导师给你另外一个分子,你又不会做了。
仔细钻研手册,你会学到更多。
6楼2012-05-20 22:30:04
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +5 vv迷 2026-03-22 5/250 2026-03-23 07:36 by Iveryant
[考研] 263求调剂 +4 yqdszhdap- 2026-03-22 4/200 2026-03-22 21:20 by 1144970272
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +11 梨花珞晚风 2026-03-17 11/550 2026-03-22 17:42 by luoyongfeng
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
信息提示
请填处理意见