24小时热门版块排行榜    

查看: 3583  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lyl163com

金虫 (正式写手)

[求助] 用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何设置为中心原子

用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何简化为中心原子,即怎么选择,怎么简化?先谢过各大侠了!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MOFs相关必读-晶体生长 晶体生长方法 初学晶体 我的
晶体作图方法 淘帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl163com

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by ys851216 at 2012-05-28 08:58:50
我的经验是使用画图工具(如diamond)在所需位置插入假原子,然后保存为cif格式,这样比在shelx中进行操作要简单很多,不过这样重新生成的cif无法直接打开,不管他,导入topos就可以了...

多谢兄台指点!
6楼2012-05-28 17:23:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

乐此不疲

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢应助~ 2012-05-23 12:30:51
首先做AutoCN 用算检查你所要的原子的配位数(图1中的 CN )是否是你要的
再双击化合物名字,跳出Crystal data 窗口 选择Adjacency Matrix(如图二)
在这个窗口中点击中心原子前面的的加号,下面显示的就是软件计算的与你原子配位的原子,检查好。如果有原子没与中心原子参与配位,那么把它选中,右击鼠标,在change type里选择No Bond。(建议把氢原子删除)改好之后然后点保存。
这个时候你回去做ADS计算,这个中心原子的简化就是对的。

1



2



3

2楼2012-05-22 23:00:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐此不疲

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lyl163com: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
先用shelx软件在配体中间插入原子,与其他原子相连,删除多余原子。保存,做一次XL运算。这个时候的CIF文件就是简化后的配体了,具体看看给你传的这个附件。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : TOPOS4.0检查MOF拓扑简易操作流程.pdf
  • 2012-05-22 23:09:02, 992.98 K
3楼2012-05-22 23:12:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl163com

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 乐此不疲 at 2012-05-22 23:12:00
先用shelx软件在配体中间插入原子,与其他原子相连,删除多余原子。保存,做一次XL运算。这个时候的CIF文件就是简化后的配体了,具体看看给你传的这个附件。

这样用shelx在配体中间插入原子呢?谢谢
4楼2012-05-28 08:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +24 医学老男孩 2026-08-13 50/2500 2026-08-15 06:38 by 学员8dgXkO
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:41 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
信息提示
请填处理意见